将制造船舰的事交付郑平后，郑成功回到船舰上。
在船上待了几天，这几天水师每天都要派水鬼冒着寒冬潜入水底，刮掉船只航行多日导致底部粘着的浮生物、贝类等，好减轻重量、恢复航速。
这些日子来，郑成功派出的探子将近段时间的消息都汇报过来了。
自从郑芝龙被清朝软禁后，南方本就错综复杂的局面顿时产生了一系列变化。
首先称霸东南沿海的郑氏集团分裂了，当中实力派的施福、黄廷、施郎等在征南将军多罗贝勒博洛的招降下，率十名总兵、十一万三千士卒归附了清朝。
本就反对降清的人在清军反耳，将郑芝龙被诓骗挟往北京的情况，更使他们心怀疑惧，坚定起兵抗清。
可惜失去郑芝龙，加上郑成功此时的威望不足，造成郑氏集团的反清势力群龙无首。在这种情况下，这些将领一时分崩离析，自寻出路。
郑芝龙的老部将林察在福州即将失守时率兵保护隆武帝的弟弟续封唐王朱聿键乘船逃往广州，在广州成立绍武政权。
郑家集团的旁系郑彩郑联两兄弟掌控着厦门的军政大权，拥兵七万，当中水师有四万余人，大小船舰四百多艘。
他们两兄弟看到满清如此对待郑芝龙，不敢投靠满清，又看到隆武去世，于是决定拥立鲁王朱以海，准备效仿郑芝龙的事迹。
郑芝龙的三弟郑鸿達考虑再三带着上万兵马决定暂时依附郑成功，四弟郑芝莞带着几千士兵投靠了郑彩。
面对清军的威胁，在郑鸿达的穿针引线下，郑成功、郑鸿逵、郑彩、郑联等人组成了郑家联盟军。
郑家联盟军组建了，虽然军力加起来怕不下十万，只是郑成功对这个联盟军不抱太高希望。
郑氏集团的直系势力郑成功、郑鸿达在郑芝龙投靠清朝后，实力大损，兵力和地盘都比不上旁系势力的郑彩、郑联。
况且郑成功打的旗号是已被清军俘杀的隆武帝，而郑彩、郑联、杨耿等人在隆武死后，转而改奉鲁监国。
正统之争，让郑家本就不稳的盟约更加脆弱。
郑成功对郑家联盟不报希望，靠人不由靠己。
趁现在清军还不重视自己，要抓紧时间发展，增强自己的实力才行。
郑芝龙掌控福建多年，郑家大公子这个名头现在还有点用，郑成功决定再去劝说一下那些福建沿海那些不肯降清的人。
郑成功让林习山统领船舰，在船只维修好后去金门，他自己带着五百士卒沿海各地招兵买马、收编郑芝龙的旧部，最终募集了两千多散兵，这极大的缓解了郑成功兵力不足的问题。
1646年十二月末，郑成功带着募集的士兵终于回到了金门！
来到荒芜的金门，郑成功为了安顿百姓，可是忙地团团转。