因为钱谦益不在，内阁中只有工部尚书王铎表示支持皇城在查明行刺案后再行开放，称“既已明诏天下，复更则失信于民”。
朱慈炯没有给出明确答案，眼前还是查明这案子的来龙去脉比较要紧，待了解了具体情况，再做决定。
于是，又单独召见了吴邦辅。吴邦辅原先是锦衣卫指挥使，查起这种事来自然是驾轻熟就。
经审讯，西角门守门太监汤正业一口咬定，发现小太监失踪后隐瞒未报是怕自己承担责任，以为他躲在什么地方了，但这条理由显然站不住脚。
朱慈炯问道：“就算他说的是真的，那么刺客进皇城后的一天两夜，究竟躲在了哪里？每晚各宫各殿都有上值的太监，难道都没人发现有刺客？”
吴邦辅伏地请罪：“臣失职，汤正业昨晚自尽了。”
“什么！”朱慈炯拍案而起，这么重要的线索竟然断了。
朱慈炯沉默了一会，问吴邦辅：“那刺客查明了身份没有？”
“臣查明了，是北方逃难南下的百姓。”
“那汤正业是谁的人？”
吴邦辅回道：“汤正业是皇城的老人了，要说是谁的人，谁也不说不上来。”
吴邦辅看着朱慈炯，欲言又止，朱慈炯看出了他的神情，便让他说出来。
“皇上觉得案子还要查么？”
朱慈炯被一语惊醒，查么？怎么查？这案子有几种可能，一是刺客是满清派的，但刺客只杀了几个小官，照理说杀了皇帝才对满清有益。二是可能是朝中有人指使的，具体是谁暂时也查不出来。三是刺客可能是自发的，勾结了宫里的小太监，从而得以行刺成功。