很快他们就提出要那些向他们臣服的藩社给他们纳贡，这些藩社一看，怎么臣服还需要纳贡？臣服不是领赏的吗？牛栏线那边的汉人不就是这么干的，只要他们表示恭顺，汉人的官府就会给他们赏赐牛羊和美酒。怎么这日本人来了，还要让他们拿礼物出来？
早已经被汉人惯坏了的土著，当然不肯给日本人纳贡，可日本武士哪怕再能挨饿，也不能吃草过日子，结果日本武士就直接下藩社抢，抢钱、抢粮、抢女人，把他们祖先的本事都拿了出来。
藩社跟日本武士的冲突一下子就爆了出来。
这些藩社被清政府称为生番，跟那些已经定居下来，归清政府关系的熟藩不同，他们虽然也学会了种植水稻，但多是刀耕火种，非常原始，主要还是靠打猎为生，因此人人善于使用刀子，甚至土枪。
他们还熟悉山林，结果到处伏击日本人，日本人此时又爆了疫病，三千多武士，能保持战斗力的不到一半。日本人5月份登上台湾岛，8月份自己都顶不住了，他们积极的跟大明磋商，希望大明解除封锁。也不提赔款了，听说满清私下答应给他们一笔赔款数目不小。
但此时大明反而提出来，由于日本入侵台湾，杀人数千，哪怕是土著，大明也不能容忍这种野蛮行为。将日本在台湾的屠杀行为，在全世界散播。同时要声明，由于日本侵台，导致大明封锁海峡，对大明商业造成了巨大的损失。
有损失当然要赔偿，让日本人目瞪口呆的是，大明竟然向他们提出了赔偿要求。
日本当局实在无法理解，这大明跟满清的表现怎么这么不一样，这还是儒家礼义廉耻熏陶了几千年的民族吗？怎么看起来就像是强盗一样。
更让日本人无法理解的是，他们明明在大明的报纸上，没有看到相关的舆论，大明舆论中，那些文人笔者甚至大多数还同情日本人，认为日本人杀生番是大快人心。
显然在面对生番和日本的立场上，文人更倾向于日本。
这即跟日本人做的工作有关，比如他们自己花钱公关，影响大明舆论。另外也跟日本和生番给人的印象有关，那些生番不但杀过洋人，杀过琉球人，其实杀害最多的，还是汉人，因此没人对他们有好印象。
日本人从清廷哪里了一笔小财，小心的询问大明要多少赔偿，如果少的话，他们就当是跟大明瓜分了这笔财富，可是大明口气很大，要价三百万两银子，还能拿出数据，证明这一年来大明贸易下降了多少，其实就是将经济危机期间贸易的下降问题，都推到了日本人身上。
日本人是打死都不肯出这笔钱的，满清才给了五十万两，大明就要三百万，做生意哪有这么做的。他们向来做惯了无本买卖，总想以小博大，跟谁都敢龇牙。
而且对他们来说，大明的封锁，无非是封住了几千个日本武士而已，明治维新后，什么都缺，就是不缺失业的武士，这些人死了，正好给国内减轻负担。论起对人生命的漠视，日本人在全世界排第二，就没人敢排第一。民国之后的中国政府算是学到了这个精髓，对人性的考虑，反倒连封建王朝时期的士大夫都不如了。有一些官员，为了工业化，可以饿死人，满清的文官反倒宁可拆了工厂，也要保住作坊工人的生计。尽管在大势面前，传统的文人士大夫的表现显得可笑，但他们的情怀，难道不值得理解吗？
当坚持到年底的时候，日本人终于支撑不住了，倒不是他们在乎那几千武士的性命，而是经济方面实在是撑不住了。为了这次侵台，他们已经付出了八百万日元，此时的日元极不稳定，当下的汇率，兑白银只相当于两百万两银子。
看到长久拖延下去，也得不到什么好之后，日本人表示他们愿意赔款。
台湾的悬案看似平稳的解决了，大明的铁甲舰只是巡回在台湾海峡，而没有去日本，可日本人因为这次事件之后的反应，却差点引起了大明跟日本之间的战争，因为他们加紧了吞并琉球王国。
这是后话，台湾问题还没结束，对大明来说，只进行到一半而已，逼退日本只是第一步，接下来逼迫满清将台湾和平的交割给大明才是最终目的。