在《越狱》的后半段，追捕逃犯的这条线与反腐的这条线交叉推进，越到后面，反腐的这条线比重越大。谭国强饰演的高培军副省长的这个角色，戏份也越来越吃重。
在后半部分的剧情设定中，警官马宏是高副省长提拔的人，高副省长对他有知遇之恩。他受高副省长的委托，极力要将米帅和米林兄弟捉拿归案。而同时，马宏又是一个心有正义感的警官。在他与米帅的较量中，他以自己一个警察的直觉，也深感米林的谋杀指控可能是被人陷害的。
米帅告诉马宏，根据他的调查，被害人其实是高副省长的情妇，因为利益问题两人起了冲突，被害人要拿着手中的材料向纪委告发他，高副省长于是雇凶杀害了被害人。而当时，米林正好路过被害人遇害的现场，于是被高副省长顺水推舟的栽赃嫁祸。
马宏受高副省长的知遇之恩，高副省长平时又伪装的很好，原先并不相信米帅的话。但在追捕的过程中，高副省长作为一个负责经济工作的高官，频频干预他的刑事侦缉工作，给他施加压力。马宏有时在高副省长面前提及对米林案件的怀疑时，总会被高培军粗暴打断。种种疑点，让马宏的心里埋下了怀疑的种子。
米帅的逃犯是一方，马宏的警察是一方，高培军的官员又是一方。三方人员各有立场，三方人员又都是智商高绝之人，互相斗法，智力激荡，矛盾迭出，看得电视机前的观众大呼过瘾。尤其是谭国强饰演的高培军，城府极深，喜怒不行于色，不给对手留下任何把柄。而且，他工作能力出色，官声也是极好。即使剧情已经很明显的揭示出高培军就是那个反派**oss，不少观众也不禁会怀疑米帅他们是不是怀疑错了，冤枉了好官。或者是编剧们故意将观众往错误的方向引，最后出来一个令人意外的结局？这也不是不可能，很多编剧就喜欢这样来耍弄观众的。
随着剧情渐渐进入尾声，矛盾冲突也更加的尖锐。在互联网上，《越狱》迷的讨论帖子已经铺天盖地。大家纷纷从前面的剧集中寻找线索，寻求答案。
“我肯定，大家都被骗了。那个高培军是好人，编剧故意这么干的，他们就是要戏弄我们这些可怜的观众。”
“我也觉得那高培军不像坏人，他工作时对基层群众挺亲切的啊？”
“别逗了，高培军是好人，那你们是说米林和米帅才是反派？那这剧还能看吗，片方那还不被全球的米粉们给喷死！”
“那你们说这到底是怎么回事，剧集已经播到20集了，还有最后两集就要结束，米帅他们看不到一点能成功扳倒高副省长的希望。”
是啊，下半部总共有22集，20集过去后，米帅一方看不出有任何翻转局面的机会，高培军才智高绝，没给对手留下任何证据。
梅花公司的编剧们该怎么处理呢？最后一段的剧情，梅花公司的编剧们依照秦天柱的提示，来了个无中生有。
米帅他们没能收集到高培军的贪腐证据，事实上也收集不到，高培军手脚做的很干净。最后，米帅想了个办法，他通过马宏逐步给高培军施加压力，隐晦地让他知道，被害者事前曾经塞给路过的米林一张纸条，上面写着一个保险柜的密码，里面有高培军贪腐的证据。
高培军心志坚定、老谋深算，并不为所动。但最后两集的剧情发展却出乎观众所料，秦天柱将最后两集的内容拍成了一部《无间道三》。
高培军表面冷静坚强，但实际上在听到米林手中还掌握有证据后，内心已经被对方层层释放的压力击垮，整个人几近精神崩溃，时不时产生幻觉。他有时自己一个人在办公室神神叨叨，说着被害人名字，讲述雇凶杀人的过程，请求情妇的原谅；有时会打开的保险柜，看看自己的脏款还在不在……而这一切，都被摄像记录了下来。
大结局，最后的画面，马宏原本指着米帅脑袋的枪，突然调转枪头，对准了高培军。
“马宏，你这是干什么？快将他们抓起来，送进大牢，把他们枪毙，枪毙！”高培军状若癫狂。
“对不起，高省长。要进大牢的是你，我已经掌握了你所有的犯罪证据，相关材料已经寄送到纪委！”
话正说完，两名纪委同志走过来对高培军面无表情地宣布了他的双规。
“不！”高培军发出了一声凄厉的惨叫。听到被双规的消息，他歇斯底里的喊叫：“你们不能这么对我，你们怎么只相信几个逃犯而不相信我？”
“我为组织做了这么多贡献，你们要讲良心哪！”
“马宏，你个王八蛋，你忘恩负义！”
马宏默默的对自己说道：“对不起，高省长，我是警察！”
至此，总共42集的国内版《越狱》正式结束。大结局当天，《越狱》的收视总人数也第一次超过了6亿人次！真是一个完美的收官。
（未完待续）