内忧和外患一向不离南朝左右，自北魏退去，内忧重又在萧齐国内点燃。
萧谌是萧鸾上位的首席功臣，自恃劳苦功高，对朝廷的行政措施，经常横插一脚，越俎代庖，推荐的人才也都就让政府设法任用。萧鸾本是眼里不容沙的人，得到报告后，顿起杀机，等到魏军撤退，立即在华林园设下酒筵，款待萧谌和王晏等人。
散席之后，萧鸾挽留萧谌稍微多坐了一会，等到谌终于告辞离开，刚走到华林閤，便被武装卫士当场逮捕。
萧鸾接着派侍从前往当面列举萧谌的罪状：“去年政变，没有你的支持，我不可能有今天。然而你一门之中有两个州长，兄弟之间，有三个封爵，朝廷对你的回报也足够丰厚了，可是你却一直心怀怨恨，盼望政局变化，甚至说出“煮熟了的饭，却连锅都端给别人”这种话，今天不得不赐卿死。”
不但斩了萧谌，还把他的两个兄弟萧诔和萧诞一起诛杀，改任监察院宫廷监察官萧衍为司州州政府行政官。
就在当天，萧鸾杀顺了手，又把萧赜的三个儿子：西阳王萧子明、南海王萧子罕、邵陵王萧子贞全都斩首。
这场突如其来的大屠杀，让国内人心惶惶，但萧鸾显然已经习惯了，并不觉得有什么不妥，在他眼里，杀人与吃饭的唯一区别仅仅就是吃完饭不久要排便，而杀人立刻就会冒血。
萧鸾的演技一直在线，御厨房供应的粽子，萧鸾一次性吃不完，就吩咐人把粽子分成四份，吃剩下的到晚上继续吃，以此彰显自己勤俭节约，后来甚至有一次把渣滓交给侍从，说：“这先别扔，留着还可以再用。”
496年春节当天，宴会上有许多银制的温酒器，萧鸾下令把它们全都销毁，改用普通的酒器，最高行政长官王晏等人立即竖起大拇指，赞扬其美德，皇城警卫军司令官萧颖胄却一语戳破了君臣的脸皮：“朝廷最重要典礼莫过春节，这个温酒器既是旧东西，也不经常使用，根本算不上奢侈，就这样毁弃，实在可惜。”
后来萧颖胄参加一次后宫举行的宴会，发现全是银器，忍不住说：“陛下之前把温酒器销毁，这项决心应该转移到这张桌子上。”
萧鸾十分羞惭，恨不能杀之而后快，但他知萧颖胄素来快人快语，而且并无大逆之心，因此放他一马。
除了假节约，萧鸾还擅长假勤政。
萧鸾处理政务非常细致，中央政府各个部门和地方政府的所有事务，他都要亲自决定，于是许多有功勋或与皇帝交好的官员，升降调补完全不归政府文官部管理，往往只是萧鸾一句话，便连升数级。
南康王府高级助理官钟嵘，上疏说：“古时候，圣明的君王，都是衡量人的才能，授给相应的官职。处理政事时，三公坐在君王身旁，一起讨论治理国家的重要决策，政府的各个部长负责实际执行，天子不过面南而坐，垂拱而治。”
奏章呈上去后，萧鸾很不高兴，对中级国务官顾暠说：“钟嵘算什么人，居然想阻挠我处理国事，你识他吗？”
顾暠说：“钟嵘虽然地位低贱，名望卑微，但所作的建议，或许有些地方可以采纳。朝廷事务十分繁杂琐碎，各有主管单位负责，而今却由君主一人亲自处理，是君主越劳苦，而臣属越安逸，绝非是个好现象。”
萧鸾本来想听顾暠好好数落一下钟嵘，想不到顾暠如此不识趣，只好假装没听见，转移话题，谈论别的事。