一代枭雄归了尘土，这是整个察哈尔部顶天的大事。贵族们商议过后，决定为大汗实施土葬。
蒙古人信奉萨满，认为万物皆有灵，尸体为鸟兽所食表示其人灵魂升天，所以盛行天葬；此外，对高僧或达官贵人，流行火葬。自格鲁派传入卫拉特后，土葬也开始流行，平民们以白布袋入穴，王公贵族则坐棺土葬。
林丹汗的尸身被屈腿盘坐于竖棺中，双手合什做佛状。卫兵将棺木放入穴中，再放入金玉等殉葬物品，然后以战马踏实踏平，不起坟堆。可怜一代大可汗，死后也不比别人多占一抔土。
沙尔巴呼图克图神色悲戚，喃喃地念经：“一时佛在舍卫国。祇树给孤独园。与大比丘僧，千二百五十人俱，皆是大阿罗汉??尔时。佛告长老舍利弗。从是西方。过十万亿佛土有世界名曰极乐。其土有佛，号阿弥陀??”
当部众沉浸在悲痛中时，潜流却在暗中涌动。
苏泰太后为了替儿子树立威信，也为了继承亡夫振兴蒙古的遗志，下令移驻河套。一时间部众皆云新汗王有重回漠南之志，人心大奋。
囊囊太后召心腹昆噶敖德斯尔密谋曰：“我腹中骨肉乃是先汗嫡子，实不忍见其将来居额哲之下，奈何？”
“您何不与苏泰母子分帐而居，如此便不分高下了”，昆噶敖德斯尔出了个主意。
怀着身孕的囊囊太后遂带着自己的阿纥土门万户与苏泰母子分帐而居。她部众很多，势力又大，柔弱的额哲竟奈何不得。
见此情景，林丹汗的大臣和妣吉们不知所从，人心惶惶。
芭德玛瑙妣吉觉得察哈尔部没希望了，遂与多尼库鲁克密谋率窦土门万户投降后金。
后金的天聪汗皇太极得知林丹汗已死的消息后，以手拊额道：“从此朕再不忧蒙古矣！”身为枭雄的他，自然不会讲什么仁义，派遣多尔衮、岳托、萨哈廉、豪格领满洲骑兵万人第三次西征察哈尔部。后金兵渡过黄河，包围了察哈尔余部。
同样打察哈尔部主意的，还有漠北的车臣汗，他给额哲写信，希望他能够率部众转移到漠北，不料使臣在中途被后金军截获。皇太极见信大惊，没料到这喀尔喀的车臣汗野心这么大，居然想挟天子以令诸侯！还好自己先出了手，不然后果不堪设想。
见后金军势大，芭德玛瑙妣吉再不犹豫，在多尼库鲁克的护送下，到皇太极的军营行幄，表示归顺，并选择了木湖尔伊济牙尔地方暂时驻牧。因为她是第一位投降后金的林丹汗遗孀，为了千金市马骨，皇太极待其极好，娶入后宫，封为衍庆宫淑妃，位居崇德五宫的第四位。并允许其抚养林丹汗之女（后嫁多尔衮）。
察哈尔部人心惶惶，乌云娜妣吉率郭阿喇克绰特万户欲北投车臣汗，却被漠北另一部落击败后俘虏，下落不明。
察哈尔的汗帐内，王公贵族和重臣们济济一堂。
“尔等都说说吧，后金大兵压境，该怎么办？”十三岁的额哲无力地问。
“如今已经走投无路，不如，不如降了吧！”大帐内传出一道细如蚊蚋的声音，却是南楚。南楚乃苏泰太后之弟，连他都想投降，可见人心涣散到何种程度。一时间，众人皆畏于满洲兵锋，欲降后金。
“不可！我察哈尔部乃成吉思汗的嫡脉，岂可做女真人的奴隶？宁为玉碎，不为瓦全，我愿护卫大汗突围”，粆图台吉大怒。他是林丹汗亲弟，颇有威望，一时又鼓舞了部分主战派的士气。