清水教远在山东，对于西南的巴山几乎没有影响，要不是十年前的山东起义怕他们中的一部分人听都没听说过，而且白莲教一直以来北重南轻，两边还有几分积怨不清。所以说，同在陕西不一样，清水教的招牌亮不起来。幸好他们拿得有刘之协、宋之清二人的帖子，又将一箱箱的银子不停的运到，再次打破了局面的平衡，起义派占据了上风，十月初巴山白莲教大起义爆发了。
做完了这件大事，按照梁明的旨意，中原情报署全面进入潜伏阶段，所有的活动全部停下，就地沉浮，就连进行的有声有色的“栽赃”（禁书）活动也不例外，除了传递消息外，整个组织不再发出一点动静。
因为他们已经留下了天大的痕迹，三地的起义爆发后不免会有白莲教众落入清军手中，以他们的秉性视死如归是不可能的，白莲教内的情况清廷很快就会有个大概的了解。而情报署以清水教的名义送去巨额资助的时候就差敲锣打鼓以壮声势了，白莲教内只要是个有心之人就会知道这个。这种情况下，“清水教”余孽自然会引起清廷的大力关注，现在自己收敛一些不过是为自保摆了。
梁明还有大事要他们做呢，可不能因小失大。
白莲教的声势闹得很大，不过情况却不大理想，早期修堡筑寨、固守一地与硬拚的作战指导使得不少白巾军（白莲教义军的称呼）分部在初期被清军各个击破，如河南、安徽举义的白巾军就是如此。除了少量义军逃入山林，大部被歼。
陕西一直是满清的军事重地，驻扎的部队也都是绿营中的精锐，对于李全等人还是绰绰有余的。陕西的白巾军先是张狂了一阵，接着就是屡战屡败，最后溃入山林。
而巴山的白巾军在吃了大亏后就施行着南山白巾军的战术，大踏步前进、后退，实施流动作战，虽然在一定时期内获得了战争主动权，粉碎了清军聚而歼之的战略企图，但由于没有建立根据地，已经丧失了主动权。
白莲教义军失败的另一个重要原因就是教、军合一的组织形式和封建家长制的管理制度，内部派系林立，战争中缺乏统一领导、计划及各部不能密切协同，亦为白巾军失败的重要原因之一。
对于白巾军的兴盛和衰败，梁明仅是冷眼旁观，并没有出手。在他的预测中，白巾军扛过今年是不成问题的，可梁明万万没想到南山白巾军会出现如此大的军事失误。十一月初，就在梁明接到情报署的回报欣喜不已时，南山白巾军一改往日作风大肆出击，竟然是想在冬季来临之时趁着大批清军撤离之际，找几个县城落脚。结果不言而喻，齐林所部被围在了来风，万余白巾军主力仅生存四千余，南山白巾军大败而回。
梁明很无奈，只得让“禁书”计划提前启动了。