此番刘君韬借着总兵府全面改革的机会，将大军装备更换、兵力扩充、兵员补充等一系列事宜同时做了，可谓是一箭数雕，大大节省了时间。
当然，几件大事同时进行，也让总兵府耗费了大量的人力、物力，不但胡德兴率领军部上下人等日夜忙碌着，刘君韬也是几乎连轴转的处理公务，商部调拨的钱粮也是如同泄洪一般花了出去。
在此期间，军部不但要对全山东的适龄青壮进行登记，而且还要在各州府、县建立训练营，并且采购海量的军服、被褥等用品。
按照刘君韬制定但是计划，在山东各州府设立训练营，在各县设立训练点，在玉山镇设立训练总营。
日后，各县征募的预备役人马先在各地县内的训练点进行基础的训练，例如：体能、队列、条例、作息习惯、读书识字等等，操练时间为期一个月；
而后，在各县训练合格的青壮便会集中到各府的训练营中进行深度操练，这些青壮将会在各府中进行进一步的操练，例如：阵型、拳脚、熟悉火器、分别兵种、学习地理和历史等知识等等，操练时间为期一个月；
最后，在各府训练合格的青壮便会由军部组织起来，全部分批拉到玉山镇的训练总营，这些青壮会在这里进行严苛的操练。
在玉山镇训练总营，所有的青壮都将进行火器实射、战阵演练、实战模拟、生存训练等等科目，操练的时间为期十五天。
按照刘君韬的这个最新训练大纲，山东镇完全可以在两、三年内，拥有十几万、甚至几十万的精锐预备役兵源，只要刘君韬愿意、总兵府钱粮足够，便可以拉起一支支源源不断的精锐大军来！
景泰二年九月，经过将近一个月的整顿，军部的改革终于走上了正轨，各军也在刘君韬的命令下，全部开往了指定的驻扎地址。
此时各军前往各处驻扎，兵力上还没有完全补充完毕，所以刘君韬便以山东镇总兵官的名义下令，山东各地的营兵全部向就近的驻扎地点集结，总兵府将对各地营兵进行整编。
各地营兵中，符合总兵府要求的兵员将会进行征训，征训合格之后便编入各军之中作为补充兵员，不合格者便由总兵府发放遣散费，全部遣散回家。
各地营兵中的将官也是如此，全都需要进行“回炉重造”，要到玉山镇进行集训，合格者才可以根据其才能授予官职，否则也要被遣散回家。
刘君韬的这
道命令发出之后，整个山东都是为之一震，各地的武将都是人心浮动，刘子安也是收集了不少消息，警告刘君韬各地有些暗流涌动。
而各地的文官也是等着看好戏，几乎所有文官都是期盼着刘君韬和麾下将领闹翻。
不过刘君韬却不为所动，坚持己见，各军也是迅速开拔到位。
与此同时，刘君韬也开始主持总兵府其余各部的改革事宜。
首先便是对商部的改革，商部可是总兵府的“钱袋子”，只要商部稳如泰山，刘君韬就有大把的钱粮推行自己的计划，而不必被朝廷发下的钱粮拴住手脚。
刘君韬决定：
将工坊司整合为将作司，司丞为马立军，负责各类新式生产工具的研发、对现有生产工具进行改进，并且根据实际生产的需要进行专项的研发，说白了这个将作司就是刘君韬设立的一个研发机构！
这个研发机构承载了刘君韬极大的期许，从今以后山东镇除了军事以外所有的技术积累都要由将作司完成，甚至刘君韬心中期盼已久的蒸汽机也是如此，需要在刘君韬的指点下，由将作司打造出来！
将贸易司整合为工商司，司丞为崔宁，负责商部所有工坊和商贸的筹建、管理、生产、各类专利的贩卖，对山东境内以及徐州、江南等地的商事进行干预，并且负责向已经购买了玉山镇各类专利的商贾、士绅收取费用。