威廉十三世的叔叔帝国内政部长迈尔斯勋爵拥护威廉十三世38岁的弟弟继位，而以华金元帅为首的军方将领却拥护四皇子接任帝位。
两方人马为了各自的利益争吵不休，而威廉十三世的葬礼刚刚结束，控制了帝国第一舰队的迈尔斯勋爵马上率领军队包围了首都。
拥护四皇子的军方高级将领只得在皇家近卫军的拼死保护下，带着四皇子狼狈逃出首都星系，和已率领2个舰队回师只留下一个多舰队继续进攻联盟的华金元帅会合。
此时的联盟因为进攻压力骤减而勉力抵挡住帝国军的进攻，可是因为害怕帝国内乱马上平息而增派援军，所以联盟主动放弃了两个星系，向更远的还没有开发过的星系仓皇逃去。
华金公爵知道联盟逃亡的消息后，自知无力追击，也就迅速整合军力，全力攻击迈尔斯勋爵的领地星系和首都星系。
就这样，帝国成立以来持续时间最长影响最深远的帝位之争开始了，这场战争足足持续了一百一十三年。
自由星系联盟的200亿军民，最后用了50多年时间一直逃到了距离帝国边界40万光年的“泰索”星系，由于之前对这个星系进行过详细的探测，所以很快在这个星系的6个可居住星球上安顿下来。
由于联盟的高级成员很多都是原帝国各行业和商业的领军人物，更重要的是拥有占原帝国3/4的高科技开发企业，所以联盟借助雄厚的技术储备和技术实力。
利用帝国内乱的时机，联盟全力发展基础设施建设和星球改造工作，以非常高的工作效率迅速在泰索星系站稳脚跟，然后马上全力开发周边星系扩充实力。
当帝国终于由号称“天龙大帝”的亨利一世结束战乱重新统一的时候，自由联盟已经发展到拥有13个星系600亿人口。
而且由于帝国的科技发展受战乱影响，以及联盟对于其高科技企业的釜底抽薪而出现倒退，而联盟的科技水平却因为底子雄厚而一日千里，联盟的科技领先了帝国近50年。
这就初步奠定了联盟与帝国进行长期战争的基础。两个国家间长达600多年的战争在帝国统一后马上就开始了。
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