开战之初，拥有近吉恩军5倍之舰艇数的联邦军处于压倒性的优势之中，但吉恩方却依KMS的能力将战局完全逆转！在米诺夫斯基粒子影响下，联邦军指挥系统完全瘫痪，而训练有素的吉恩军MS部队则趁势接近联邦战舰，并将其逐一击沉，虽然联邦军也用战舰的对空机炮进行反击，但在拥有宇宙战斗机无法比拟的重装甲的扎古面前却有如蚊叮虫咬，起不到任何作用（经历了如此惨痛的教训后，联邦军在重建宇宙舰队的“宾森计划”中专门强化了战舰的对MS防空机炮，当然，这是后话）。
由于扎古的外型与人极为相似，而宇宙中的参照物极少使得人对距离感和物体的大小难以把握，因此，在许多地方都出现了联邦士兵将接近中的扎古误认为是身着标准服（ノーマルスーツ）的宇宙步兵，当他们发现这些能够使用280cm核子火箭筒将战舰一击击沉的“宇宙步兵”是身高18m的巨人时，一切都已经晚了。联邦军宇宙舰队重创！
在给予联邦舰队巨大打击后，吉恩军终于决心实施决定胜负的“不列颠作战”（象征因失去殖民地而国力衰退的大英帝国）！充分利用了MS无重力条件下作业能力的吉恩军，对SIDE2第8号殖民卫星“ISLANDEFFICIAL”施加了若干补强后，点燃了设置在其后部的核脉冲推进器，目标：联邦军本部--贾布罗。同时，确保殖民卫星进路的MS部队也与联邦阻击舰队展开了血战。
1月4日21时30分，“ISLANDEFFICIAL”受地球重力吸引，进入自由落体状态，但联邦残存舰队仍试图挽回失败的命运，一次次向吉恩护卫舰队发动攻击，虽然吉恩军在数量上始终处于劣势，但在MS的活跃下仍顽强地击退了联邦的攻势。
1月10日8时27分，外壁几近崩解的殖民地终于进入大气圈，40分钟后贾布罗将在这直径6.4KM，全长40KM的巨大金属块的撞击下消失，吉恩军胜利在望。
但就在这时，意外发生了！受持续至今的战斗影响而破坏的殖民地于8时35分在阿拉伯上空解体，解体后最大的一部分落向澳洲东岸的悉尼，其余部分分别散落到北美、太平洋各地，贾布罗在这千钧一发之际奇迹般地得救了。
1月15日，不甘心失败的吉恩军将目标锁定SIDE5（鲁姆）第11号殖民地“伍特福德”，决心再次实施“不列颠作战”！闻讯后的联邦深知若殖民卫星再次进入坠落轨道这场战争必败无疑，因此立刻集结“所有可集结之舰艇”，在名将雷比尔将军的指挥下开赴鲁姆，与吉恩军决一死战！1月15日22时14分，雷比尔舰队于SIDE5邻近空域发现了正在安装核脉冲引擎的吉恩军MS部队。
“地球的命运在此一战，期待诸位的奋斗！”雷比尔的这句话拉开了史上最大舰队战--鲁姆战役的序幕。交战之初，为了守护诸多正在安装核脉冲引擎的工作舰和MS，吉恩方不得不将本来为数不多的舰队分兵作战，这使拥有3倍战力的联邦处于极大的优势之中。22时40分，眼看战力徒然消耗的吉恩舰队司令官多兹鲁·扎比决定放弃安装核脉冲引擎，与联邦军堂堂正正地打上一场。在两军混战的状态下，MS的价值骤然显现，众多优秀的MS飞行员驾驶着爱机熟练地穿梭于联邦舰队之间，将笨拙的联邦战舰一一击沉，而GUNDAM史上的传奇人物夏亚（シャア）更是以“赤色彗星”之名威震四方。
16日3时10分，雷比尔将军搭乘的联邦旗舰“阿肯南”号沉没，将军本人被吉恩黑色三连星部队俘获。同日4时24分联邦舰队败北，全军脱离战线。此役，联邦军损失了投入总兵力的80%，可谓惨败。
一周间战争与鲁姆战役均以吉恩军的完胜而告终，此后，遭受毁灭性打击的联邦宇宙舰队退守月神二号基地，制宙权牢牢掌握在吉恩军手中。表面上，吉恩军似乎完全压倒了联邦，然而，开战至今，吉恩军所受的损失也是巨大的[注3]，大量MS的损失，特别是众多优秀MS飞行员的阵亡预示着吉恩悲剧的开始..............
注：1、キンツェム事件：0077年3月15日，吉恩本土SIDE3第25号殖民卫星“キンツェム”公然反对吉恩公国的对联邦政策，对此，公国军立刻以武力进行镇压，机动教导大队作为主力参加了这次行动，这也是史上第一次将MS投入实战。叛乱很快就被平息，被逮捕的相关人员共计281人，审查后，26人被起诉，其中24人被判死刑，后根据公王的示意，将12人改判为无期徒刑，12人被处死。这个结果使SIDE3的舆论一时间处于窒息状态。
2、サイド６革命：0078年7月9日，SIDE6知事选举，反联邦的知事候选人朗克（ランク）当选，但由于他的的票数与前任知事马克德威尔（マクドウェル）的票数十分接近，引发了两人所属派阀之间的激烈争斗，这使选举管理委员会不得不宣布进入暂不公布选举结果的特别状态。担心选举结果被推翻的朗克向吉恩公国求援，公国军随即派遣MS部队，强行介入此次事件，最后使一向稳健的SIDE6树立了非亲联邦的政权，使其他SIDE和联邦政府都深感震惊。（由于公国军巧妙的情报操作使吉恩军事介入的事实在很久以后才公之于众）
3、关于吉恩军的损失，主要是两次战役，一是“不列颠作战”时，由于需要长时间连续作战，护卫殖民卫星的吉恩军MS都加装了大型燃料存储背囊，结果导致机动性大幅下降，多数MS都被联邦阻击舰队击落。二是鲁姆战役时，有大量的MS在给殖民卫星安装核脉冲引擎时被联邦舰队击落。以上两次战役的损失都大大超出了吉恩军方的预想，而意外失去了大量熟练飞行员的吉恩军受到的打击却是致命的。
五、吉恩的误算
经历了一周间战争与鲁姆战役两次大战之后，吉恩公国军为了进行地球侵攻作战又在地球投入了相当多的兵力。然而，在前两次战役中损失了大量扎古与优秀MS飞行员的公国军其实已是强弩之末，联邦军成功营救雷比尔将军，并在南极条约签定前一刻发表了“吉恩无兵”之演说更是使吉恩公国的如意算盘全部落空，处于一种进退两难的尴尬境地，实施地球侵攻作战实在是无耐之举。战局进入胶着状态后，吉恩国力贫弱的劣势开始慢慢暴露出来，其中最明显的就是MS飞行员素质的低下。驾驶技术不熟练的新兵常常将推进器燃料迅速耗尽，导致MS丧失战斗能力，这对原本就兵力不足的吉恩军来说无疑是雪上加霜。对此深感忧虑的吉恩军部高层开始暗中向ZEONIC社施加压力，希望强化起动力的次期泛用MS能早日问世。
但是在这个时候，ZEONIC社中的MS生产线大部分都被地球侵攻作战使用的局地战用MS所占据，况且MS06F型又是完成度相当高的机体，因此，ZEONIC社并没有十分认真地考虑吉恩军部的提案。（虽然至今为止，应一部分活跃在前线的王牌的要求，ZEONIC社提供了一批推力增加了1/3、在熟练驾驶员的操纵下可以达到普通F型3倍性能的MS06S型，但由于对操纵技术要求过高，并不适合作为主力MS而大批量生产。）ZEONIC社认为，MS06F就当时而言是性价比非常出色的机体，虽然还存在改良的余地，但这并不是问题的关键。在ZEONIC社看来，前线MS事故频发的原因并不在于硬件，而是软件--MS操纵系统的问题。因此，在エイヴォス社的协力下，ZEONIC社对MS06的操纵系统和模拟系统进行了大幅修改，对于机体本身只做了少量的强化（机体轻量化，总推力增加了约20%）后，于地球侵攻作战发动后不久完成了MS06F2型。
虽然机体的改动并不是很大，但由于有了全新机体制御系统的支持，F2型受到了前线士兵的一致好评，新兵的被弹率也有了一定程度的下降。军部虽然也对F2型的性能表示满意，但处于自身战略变化的需要，吉恩军仍然提出了开发能够替代F型的高性能机体的愿望。
在这种情况下，ZEONIC社以提高机动性为前提，以F2型为基础对扎古进行了再设计。其成果就是引擎推力增强了约1.5倍、引入增速用推进器、通称为“高机动型扎古”的MS06R型。
0079年3月，用于进行各种测试的两架R型试作机（MS06RP）运抵吉恩军月面基地格拉那达。与F2型相比，R型的腰部推进器作了大型化处理，足部首次增设了大型增速用推进器，核心引擎也采用了最新的ZAS-MI14型。ZEONIC社的顶级工程师艾里奥特·雷姆（エリオット?；；レム）亲自进行了为期两周的测试。而看到过R型的高机动飞行测试、手动操纵下的机体保持测试的人都无法否认R型有着远远凌驾于以往06系MS的高性能。
0079年4月，R型机正式投入量产，但由于引擎商方面出现了问题（主要是新型引擎的质量问题），MS06R在生产了22架后，量产计划中断。先期量产的这批机体被配属到本国防卫部队、各要塞基地以及侦察舰队进行实战测试。但是这时，开战至今大量优秀MS飞行员阵亡所导致的问题体现出来了，由于飞行员的能力不足以引出机体的性能，大部分R型不但没能取得预想中的战果，这架凝聚着ZEONIC社心血的机体反而不断遭到使用者的抱怨。最后，军部不得不以使用条件过于复杂，在低价格、简便性方面存在缺陷为由废除了R型的量产计划。
然而，有意思的是，MS06R在驾驶技术娴熟的机师，特别是王牌机师中却有着极高的评价，“一角鬼”中川雅哉、“白狼”松永真、“灰狮鹫”艾里克·曼斯菲尔德等吉恩TOPACE使用R型机都取得了令人惊讶的战绩。在量产计划被废止后，由于各地指挥官、王牌机师纷纷申请使用R型机，军部不得不将一部分MS06R回收后发放给各地王牌，但仍无法满足全部需要，当时在王牌之间甚至出现了“想要得到R型机比击沉一艘战舰还要困难”的说法，这也算是对在MS06R上倾注了大量心力的ZEONIC社的回报吧。
六、ZEONIC的悲剧
如今，吉恩军的“扎古”已经和成为传说的“高达”一起，成为了MS的代名词。从开战之初起，被称为一年战争杰作机的“扎古”就作为吉恩军的主力而活跃，使各地战场上的联邦军陷入苦战。
然而，吉恩军开发可以替代扎古的主力泛用机的进程却相当缓慢，其原因就在于06系发展到F型以后，机体的完成度已经达到了相当的高度，各方面的平衡性也很理想，这使得开发者的思维一时间很难摆脱扎古的构架（F2型和R型就是很好的例子，前者是在F基础上的强化，而后者则只是以F2为基础加以改良）。如何能够开发出全面超越扎古的泛用型MS？这个问题的难度对ZEONIC社来说并不亚于当初凭空设计MS。
MS06R的量产计划被废止后，ZEONIC社仍然在为次期主力泛用机的开发而努力，然而进展一直不大。对此，逐渐失去耐心的吉恩国防省兵器开发局决定将ZEONIC社的宇宙用MS制御系统授予当时以开发陆战型MS见长的ZIMMAD社，让其对本社开发的陆战用重MSドム（MS09）进行宇宙型修改。这使一直以来都以吉恩军王牌开发商自居的ZEONIC社顿时觉得颜面扫地。
为了恢复损失的威信，ZEONIC社在极为秘密的条件下，将一台以MS-06R为蓝本，换装了新型热核引擎的试作机送往吉恩兵器开发部，要求与ZIMMAD社的宇宙用MS09（MS09R）进行竞争，这台MS就是被称为“试作改良型高机动扎古”的MS-06-RP2。（原本军方已经决定将MS09R作为宇宙战主力，但ZEONIC社通过本社出身的吉恩技术将校向军部施压，强行要求对两机进行测试对比。）
在计划上，MS-06-RP2是以光束兵器作为标准装备的，但由于开发周期过短，在机体冷却效率上的问题无法得到很好的解决，因此只能在短时间内使用ビーム?；サーベル和ビーム?；ガン等程度的光束武器，无法达到将光束兵器标准化的目标。对此，技术人员索性放弃了使用光束武器的念头，将主推进器和辅助推进器的出力再度强化，燃料搭载量增加18%，装甲首次采用了ルナチタニウム（与GUNDAM的装甲质材相同）。从外表上看，此机仍然是扎古，但实际上它已经是和扎古完全不同的MS了。
在与ZIMMAD社的竞作中，MS-06-RP2显示出了令MS09R望尘莫及的机动性，但它有着与MS06R同样的弱点，那就是操纵性不佳，加之成本又大大超出了量产机的水平，因此军部再次否决了MS-06-R2的量产计划，表示仍将采用MS09R作为宇宙用主力机体。最终，拥有极高性能的MS-06-R2还是落得个惨淡收场，总共只生产了4台，除了1台留作社内测试使用外，其余都配备给了善于高机动战的王牌机师（有幸使用3台R2的分别是“真紅の稲妻”ジョニー?；ライデン少佐、“黒犬獣”ギャビー?；ハザード中佐、“蒼太子”ロバート?；ギリアム大佐，个个都是一年战争中的顶级王牌）。
最后再说一些题外话，似乎所谓“次期主力MS”命中注定是要多灾多难的，几乎就在吉恩决定以MS09R作为宇宙战主力的同时，吉恩情报部传来了联邦军掌握了エネルギーＣＡＰ(EnergyCAPACIT0R)技术，并据此开发出了MS用光束兵器的消息，而且已经证实此光束兵器可以达到与吉恩姆塞级巡洋舰主炮同等级的威力。如此一来，MS09R对实弹系兵器引以为傲的重装甲反而成为了无用的累赘，于是吉恩兵器开发局再次提出“次期主力MS”必须以光束武器为标准装备的口号。ZEONIC社以此为契机，投入了几乎全部的资金和技术（特意从培曾基地招回了エリオット?；レム和セイ?；ウエノ等顶级工程师），对原先留在社中的MS-06-2RP进行改造，完成了可以正常使用ビームライフル和ビームサーベル等光束武器的YMS-14(ゲルググ)，并在竞作中击败了ZIMMAD社的YMS-15(ギャン)，总算扬眉吐气了一番。但此时吉恩已显败相，0079年9月，吉恩公国修正《战时国家总动员法》，允许军队招收学生兵，同时开始征召19岁以上文科系毕业生，加之以本土决战为预想的《国民义勇兵法》出台，除孕妇、乳幼儿童、功能障碍者、病人外全民皆兵，因此吉恩MS驾驶员的素质可谓差到极点，而有着不输与GUNDAM性能的MS-14量产机在还未及显示其真正价值之前就已经消失在宇宙无尽的黑暗之中了。