恼火虽归恼火，在攻陷重庆城之后，张献忠还是决定仁慈一把，自己过去不是宣布，若有抵抗，攻陷城墙之后，鸡犬不留吗？
看到下面一排排俘虏，张献忠只是下令砍掉对方手臂，这可比斩杀这帮人仁慈多了，得意之处，张献忠想张献忠内心琢磨，史书大概会写先帝兵进四川，重庆军民不降，先帝本下旨鸡犬不留，但最后仁慈的只砍掉对方右臂而已。
其后吉星高照，即便龙文光令郫县县令赵佳炜挖掘都江堰（碧蜀说是看到各个壕沟干涸，挖开都江堰以增加护城河水深），也无济于事，岷江水流来的时候张献忠竟然神奇的攻占成都。
先是斩杀蜀王一家，没收其家财，看到数不尽的金银珠宝，看到蜀王宗亲竟然霸占了整个成都平原7成的肥田沃土，心中那份气恼可想而知。
如此迅速的斩杀了蜀王世子，发兵攻打蜀王宗亲大本营灌县（也就是今天都江堰），为了防止蜀王宗亲逃走，在灌县张献忠第一次屠城，不分男女老幼一律屠杀殆尽。
其时崇祯自杀的消息早已经传遍四川各地，整个四川人心惶惶不安，现在看到张献忠占领成都，大有霸占一方的架势，各地都出现投奔张献忠，归顺大西政权的热潮。
有支持者当然也有反对者，在这热潮之中，也有很多人认为张献忠不过是流寇出身，再加上嗜杀的恶名声，在一些乡绅、官员带领下高举反张的大旗。
在这个时候，丞相汪兆麟劝诫道：四川民众较多，向来有点排外，要治理好四川，就必须象刘备、诸葛亮那样。
在大汉的时候，刘璋等人暗弱，民众不服。刘备、诸葛亮治理四川的时候，采用秦朝的法典，为政严苛，虽然一日数起杀人案件，但在刘备、诸葛亮弹压下，都一一被制服了。
而今大明律令较为宽松，大王进入四川，也需象刘备、诸葛亮那样，通过严苛刑法进行整治以治蜀。
张献忠感到内心异常惬意，口中连连称妙，当即决定采用胡萝卜加大棒的政策，一面下令全川免赋三年，而另一面加大对反抗势力的打击。
为了防备成都城内大明郡王、郡主、锦衣卫死灰复燃，张献忠在成都让所有人都登记在册，五日一验，三日一点，如有逃逸者，全家连坐，以避免乱民逃逸。
为了肃清大明在成都的耳目，张献忠命令老营士兵在成都进行巡逻，发现那些形迹可疑的，当即逮捕杀戮。
有一次，在成都一个寺庙里面发现蜀王的一个儿子，也就是一个郡王，张献忠按照刑律，将该寺庙近百个僧徒全部屠戮殆尽。
这可让人看到张献忠雷厉风行，言行禁止的作风，一时之间，大家害怕受到牵连，一些胆小害怕全家受牵连的，纷纷告发，将窝藏的嫌犯叫出来，有的搞慢了的，全家被屠戮。
看来汪丞相说得对，一切都向着自己想要的方面发展，听说成都被占，蜀王一家大小被屠戮殆尽，四川民众惊慌失措，一夜之间也接受了自己的统治，正如接受李瞎子那样接受自己。
一切都是那样顺利，就连李瞎子想派大将马科与自己夺取四川，也被张献忠打败，逃往汉中。
但在那之后风云突变，先是李瞎子临时换将，义子张可旺兵败汉中。
接着南明弘光帝朱由菘在金陵继位，前礼部尚书、四省总督、巴县人王应熊在遵义就任总督，大会各地总督、巡抚之后，决定讨伐张献忠。
一夜之间，张献忠感到形势发生逆转，先是四川各地出现各种儿歌，说张献忠将要杀光所有四川人。
接着，马元利兵败蓬州被杀，四川各地义军风起云涌；川南的南明各路大军先攻陷叙州府，继而占领重庆府。
面对南明的反扑，张献忠进行血腥镇压，一面令各部剿灭当地义军，凡是胆敢反对者，一面令义子张可旺攻打叙州府，义子张文秀率部攻打重庆府。
义子张文秀本来驻军安岳，准备率军攻打重庆府，但其时杨昭已占领顺庆府，如芒刺在背，若大西军全力攻打重庆府杨昭突然攻打潼川州，如此明军必败无疑。
而在此时派往顺庆的细作来报，那个杨昭年龄青青竟然学大西政权那样不但打击豪强，而且还清丈土地，清理户口，征收商业税，大西政权不敢做的，他都做了。
更让张献忠欣喜的杨昭在顺庆多次杀戮那些劣绅，在上月竟然以贪污罪名逮捕前任顺庆知府史谨宸，一些人言之凿凿的说明军在顺庆城内矛盾重重。
更让张献忠难以容忍的是杨昭竟然明里暗里的支持保宁府、潼川州、巴州的反抗势力对抗大西军，正如丞相汪兆麟所说的那样，杨昭过去归还马元利尸体那不过是缓兵之计，当势力稍稍稳定之后，立马对大西政权下黑手。
更严重的杨昭在川北，樊一蘅在川南，曾英在川东对大西政权形成隐性包围圈，在这种情况下，张献忠决定抛弃与忠勇军事实上的停战默契，派白文选攻打射洪、蓬溪县城以引得杨昭援助，然后利用埋伏在暗处的兵马，利用野战优势一举大败忠勇军，然后趁胜追击，直下顺庆城，消除这个川北钉子。
现在可好，杨昭只用三天时间大败白文选、王复臣的万余人马，然后挟大败白文选、王复臣的余威南下，逼迫义子张文秀退回涪江以西的遂宁城，在短短不到十天功夫连下合州、蓬溪等5个县城，兵锋之盛，势不可挡。
;