后来，在闯出名堂后虽然高举着“只杀贪官，不杀顺民”，但毫无疑问，所过之处，高官巨富无不身受其害，而兵荒马乱的，其他民众为了自保，也受其大军的毒害。
在李自成进入北京的时候，张献忠再次入川，准备以四川为基础，建立所谓的大西国，然后与李自成争夺天下，在这个过程中，虽然颇为残暴，但还是颇多节制，至少在张献忠自己认为，自己对川民够好了。
一路进军，张献忠对不归附的明朝宗室，明军将领，明军官员进行屠戮，如大明的瑞王、蜀王，巡抚龙文光、陈士奇……..。
对普通民众，如在重庆，对俘获的明军，不像先前放话那样屠戮殆尽，将其胳膊砍了，虽然增加了川人的恐惧，但无疑也激起部分川民的反抗。
在进入成都后，张献忠还是本着以四川为基础，建立新政权，以与李自成、南明、蛮清争夺天下。
如宣布在四川免税三年，妄图以此收括民心。
如将绵阳人严锡命任命为右丞相，将江鼎镇、龚完敬等官员任命为尚书，如此种种，无疑是想以四川为基础，然后与蛮清、南明争夺天下。
张献忠种种作为还是取得很大效果，在其后不到半年时间内，不但大败李自成入蜀的马科部，整个四川除了播州（明朝遵义属于四川）、松藩卫（少数民族聚居区）、蓬州（本文主角）之外全部纳入其统治范畴，一时之间声势喧天，无与伦比。
但小吏出身的张献忠没有考虑到民生问题，在其攻打成都的时候，四川巡抚龙文光令郫县县令赵佳炜挖掘都江堰，如此造成成都平原遭到破坏，从而让成都平原这一古代中国最富庶的地区水患不断。（李冰在修都江堰水利工程之前成都平原千里泽国，灾害连连。）
更令张献忠始料不及的是李自成迅速败亡，南明死灰复燃，南明任命巴县人王应熊，叙州人樊一蘅组织云贵地区明军展开反扑。
再加上张献忠自恃英勇，效仿刘备、诸葛亮等人治理四川为政甚严，如此造成各地民众二次再起义，就像历史上那样殷承柞、谯应瑞、冯有庆领导明军与义军光复川北重镇顺庆府，曾英率领残部与义军光复重庆府，杨展率领残部占领嘉定府一些州县，如此严重削弱了张献忠的统治。
在四川士绅反扑之下，张献忠变本加厉，对川人进行更加血腥的统治，如以蛮清奸细为由，斩杀数百个书生，派出人马前往各地打粮，到
当然，张献忠在四川是有杀戮的，杀戮也是非常之重的，如在重庆，将投降明军手臂砍掉，如不加区别屠戮民众，比如派兵进行劫掠，正如其所说那样：“只杀贪官，不杀顺民，对抵抗的民众，不加区别的杀戮。
但张献忠真正开始对川民杀戮应该在1645年6月开始的（其间当然屠戮了蜀王宗室，杀害很多反对官绅、军民），顺庆军民在殷承柞、谯应瑞、冯有庆等人组织下发动川军起义，攻克川北重镇顺庆城，迫使张献忠在这年9月亲率大军历时数日重新占领顺庆城后才真正开始屠戮川人。
而在第二年（1646年）8月张献忠放弃成都一路北撤，在这年十二月份被蛮清突袭之后乱箭射死，如此观之张献忠屠川时间不过一年多而已。
其次，从军纪上来说，就是很多公开污蔑张献忠的人都承认大西军军纪甚严，若是屠杀那只会是有组织的屠杀，即便真的做到这一点，但自古以来兵过如匪，民众喜欢躲军队，如此在短短一年时间流寇最多造成这些地方人数损失过半。
最后，从控制地盘来分析，在南明全力反扑之下，张献忠控制地盘张献忠控制地盘不过成都府，龙安府、保宁府、（历史上还有顺庆府、潼川州），其统辖地域不过川省的一半，其控制的人口不过川人的3/5而已。
而在四川的其他地方，如松藩府、巴州、达州大西军从来没有占领的地方，不可能造成任何人员的屠戮。
如夔州府、重庆府，明军在大西军屠杀之前已经一举夺回这些地盘，造成人员损失有限。
叙州府、嘉定府为大西军、南明各部相互争夺重点，如此这些地方顶多被屠戮3成而已。
如此看来，在明末清初大西军屠杀川人2成基本可信。
而在这个时空，由于杨昭横空出世，大西军未能攻破被义军夺回的顺庆城，多番劝说张献忠不要屠杀川人，再加上多番出兵阻止大屠杀，如此张献忠屠戮川人在2成左右是基本可信的。
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