这个时候，军师刘伯温发挥了自己的才能，他建议：北上增援要想速战速决，至少要带上二十万大军，徐达、常遇春、郭英、汤和等淮北的老将们，熟悉淮北的情况，去了就可以作战，无需从头熟悉情况，而且他们在淮北一带拥有很高的威望，从声势上就可震慑元军。
留下来的将军们分成三部：第一步，由朱文正、赵德胜、邓愈镇守洪都，放弃周边的几个小城，将兵力收缩进洪都，全力守住洪都城。
第二步，由胡大海、蓝玉、李文忠三位将军，全力牵制住方国珍和张士诚的南部集团的大部分兵力，使其不能与陈友谅合谋。
第三步，暂时放弃梅城和黄州，全力守住宜城、池州和饶州，确保江南大部分的城镇。
第四步，巢湖水师一部分留守宜城，另一部退回应天城，防止陈友谅、张士诚分别从长江上、下游侵犯应天城。
吴国公部署完江南的军事后，分别给洪都的朱文正、水师元帅缪永安、应天城的沐英，各自写了一封书信，严明坚守三个月，待吴国公率主力兴师回江南，应天城的一切事务由沐英全权处理，各部营服从其节制。
吴国公与军师刘伯温亲率主力，北上增援刘福通、小明王韩林儿去了。陈友谅并不知道，等他得到消息时，已是半个月后了，而朱元璋的鄱阳湖各部则完成了兵力的收缩，退守在各主要城镇内。
陈友谅派人给张士诚传信，在信中告诉张士诚，朱元璋率大部分兵力，已经北上增援小明王去了，目前朱元璋的江南各城，兵力空虚，正是占领的好时机，要求张士诚马上出兵，与自己夹击应天城。
同时，陈友谅开始整合各部，收拢兵力，在采石矶召开了军事议事会议。
陈友谅的军事议事召开的很失败，部将们意见不统一，一部分认为，朱元璋北上后，江南的兵力空虚，乘机各个击败，消减他们的实力，再进行攻城战；
另一部分建议，集中兵力，分成陆路和水路两路，直捣应天城；
第三部分认为，分兵两路，一路攻取洪都，攻下洪都后，再收取鄱阳湖周边城市；第二路则是从水路再次向应天城进击。
第一条建议，是老成持重之举，逐步削弱朱元璋江南留下的兵力，最后进攻城市，暂时收益不大，但是稳妥，是稳打稳扎的打法。
第二条建议，是冒险的的做法，但是对朱元璋却是致命的打法，这种打法，会使沐英的兵力进行了分散，会使沐英陷入险境，最后的结局是应天城朝不保夕，很有可能失陷。
陈友谅对上次应天城下的失败，一直耿耿入怀，总想着赢回脸面。采用了第三条建议，最后决定：以二十万大军，在其弟弟陈友富的带领下，进攻洪都城，牵制鄱阳湖一带的主要兵力；自己则亲率四十万大军，千余艘楼舰，由水路顺长江而下，攻取应天城。
沐英在应天城内，接到义父朱元璋的来信后，大吃一惊，义父率主力北上，江南空虚，陈友谅、张士诚定会乘虚而入，应天城则危矣。
沐英不敢大意，立刻请缪大亨将军一同到了国公府，找到了马夫人。沐英将情况一一禀告了马夫人，沐英说：“义母，目前情况紧急，我们的水师，在长江上是无法阻止陈友谅的，必须在长江上设置层层障碍，进行层层的阻击，迟缓陈友谅的进攻，坚持到义父率大军回来。”
马夫人说：“目前兵力有限，如何阻击？应天城周边又如何布防？沐儿，你有何主张？”
沐英说：“其一，缪大亨将军坐镇应天城，我将汤山王正明的三万新兵调进应天城内，交付给缪将军指挥，确保应天城的防务安全。
第二、令陈达金二万人，与张德胜的水师二万人，一同守住江州，死死的掐住张士诚攻向应天城的水上通道。
第三、潘成龙的二万人，支援毗陵城的防务，赵权的二万人驻守丹徒，作为毗陵城的预备队。
第四、沐英亲率中军营及王顺的二万精骑，与缪永安大帅一起，至彭泽的泾江口江面上进行布防。从泾江口至宜城一线的江面，设置至少十道防线，层层阻击陈友谅的军队东进，拖延时间，等待吴国公率大部队凯旋归来。”
马夫人想了好一会，说：“沐儿，将在外，君令有所不受，我支持你的做法，不能将战火带到应天城来，这次与上次不一样，上次有你义父坐镇，张士诚不敢来犯，你义父如今不在，只要陈友谅打到应天城下，张士诚就会前来分杯羹，造成两路夹攻，应天城就危矣。如果能将陈友谅阻击在宜城之外，张士诚必不敢轻举妄动。”
沐英向缪大亨将军说了声：“应天城就拜托将军了！”
缪大亨将军也是员虎将，他也拱了拱手说：“沐小将军严重了，我在城在，我死也必保城在，宁愿战死，以报国公知遇之恩，也绝不苟活。”
沐英召集自己的部下议事后，各部按照沐英的指令，开始紧急的进入各自的防务中，王正明回了淮南定远，他将负责沐英弩箭、弩弓的补充，以及招募新兵，为沐英筹集粮饷。他的所有物资，将会直接运往宜城一线。
王顺的一万精骑已经提前出发，沐英带着重弩营的一万将士，以及中军营的二万将士，和岳父缪永忠的水师一起，顺水路也出发了。沐英途中飞鸽急令赵猛率二万人，向彭泽行军，支援沐英守住长江防线，张兴武率余下的一万多士兵守饶州。
饶州是胡大海、蓝玉、李文忠等人的退路，也是洪都的侧翼，必须守住。
沐英到了宜城后，召集了缪永安等水师将领议事，缪永安将军是如玉的伯父，所以在此次议事会议中，是很支持沐英的，尤其是沐英受马夫人的委托，其他将军们再不服气，也不敢造次一二。
沐英在议事中分析，陈友谅会集中兵力，沿长江攻击，再次侵犯应天，为了阻止陈友谅的水师，决定从泾江口至宜城，设置不少于十道的阻击阵地进行防御，命令如下：