于是不甘心变成机器人干电池的人类开始了反抗，他们会想尽一切办法来抵抗，逃跑，甚至是自杀。
无奈之下，机器就创造了一个叫做矩阵的虚拟现实世界。
通过深入人类脑部的仪器，母体模拟出一个世界。
而矩阵这个虚拟世界的作用就是让人类生活在虚拟之中，然后一生都在安静的为机器人提供电能，于是这样人和机器就出现了共存关系。
然而这项技术本来也是二十二世纪人类自己所发明的虚拟现实的用来消遣娱乐的技术。
因为在二十二世纪初蓝星的各项资源都接近枯竭，人类的任何活动基本上都离不开能源，而又加上当时刚刚发明人工智能，让机器人大量代替了人类工作。
于是为了应付大量的失业潮，让没有工作的人类不至于闲的无聊去搞破坏，所以虚拟现实技术就这样被发明了。
通过对神经信号的翻译和模拟，就可以在人类的脑海里面模拟出各种各样的虚拟场景以及画面，让人类的意识犹如声临其境一般。
这样就可以达到只消耗一点点的电能，就可以让人类娱乐一整天，甚至是一整年，一辈子的目的了。
在由电脑模拟出来的虚拟世界，基本上想要什么就有什么，想干什么就有什么，这些就不用担心失去工作的人类会闹事，站街，举牌了。
而人类战败投降之后，人工智能为了能够让人类安心的当一个生物发电池于是就创造了一个虚拟的矩阵世界，把人类的意识养在里面。
然而，高超的人工智能虽然有了自我意识，到那时却不能理解人类的感情。
所以由于人工智能不能理解人类的感情，于是制造出来的矩阵世界并不完美，所以总有那么一小部分人，会发现虚拟现实世界有异常。
而这些人越来越多，不加控制的话，就会导致这个虚拟现实的矩阵崩溃，所有连接在矩阵世界的人类就会死亡。
而没了人类的生物电池，人工智能以及人工智能所控制的机器人也都会失去电能而变成一堆废铁了。
机器人制造的最初两个母体，一个是完美世界，一个是不太完美的世界，全部都失败了。
机器的领袖白发设计师，在另一个探测人类感情的只能程序，也就是先知的建议下，采用了锡安的制度。
也就是，设计师会创建叫做救世主的升级程序，用来探测人类的感情，同时将感觉到母体也就是虚拟世界矩阵，不真实的人类释放出去。这些人类进入叫做锡安的城市，以避免母体的崩溃。
这样维持大约三四十年以后，机器人就会进行母体的升级，让救世主程序回到源代码中，释放自己所有的代码，同时重新组织另一个锡安。
而旧有的那个锡安中的几十万人类，都会被机器军团杀光，完成系统的重置。
这样一来，母体可以通过不断升级和不断清除异端者，继续维持下去。
之前已经连续升级了5次，也就是说这个母体或者叫做虚拟矩阵世界，已经维持了差不多一两百年了。
在第6次时，先知这个程序开始有了人类的感情。
她同情这些必将被杀死的人类，不愿意他们重复悲惨的命运。
而先知具有检索矩阵，通过算法预测未来的能力。
她知道，第6个救世主尼奥，会和前面的5个不同。
而这第六个救世主就是李秀刚刚抬头所看到的从主管半公室里走出来的那个英俊的白人男青年了。
这第六位尼奥救世主与前面五位救世主的做法是不同的，在关键时候，前面5个救世主，选择的是释放代码重建锡安，以保证人类和机器都能生存下去。
而这一届救世主尼奥，因为同崔妮蒂的热恋，会选择救她而不去救全世界。