过程是在明万历二十一年公元1593年8月13日，有李氏朝鲜王国平民汇报，宣称看到倭舰出现在尚庆右道巨济岛附近集结。
故此李氏朝鲜军营方面，在得到消息后的第二日清晨，李氏朝鲜全罗左道水军节度使：李舜臣，就派出了6艘板屋船去引诱倭舰。
而幕府水师第三军中务少辅：胁坂安治，的海军在见到板屋船后，马上就追踪上来，一直追到闲山岛附近的广阔海域，与李氏朝鲜全罗左道的水师相遇。
在李氏朝鲜全罗左道水军节度使与倭军的前两次交锋中，李氏朝鲜全罗左道水军节度使均采用的是，线型或圆型的连续式的进攻阵型。
虽然这种战术对于击溃敌方舰队很有效，但是也会让很大一部份的敌舰得以逃脱，使得无法有效消灭敌方军力。
为了克服这个缺点，李氏朝鲜全罗左道水军节度使在此次海战中，摆出了新型的鹤翼阵或称U型阵，意在不但要击溃倭军舰队，还要将之包围进而歼灭。
倭军的战术则是先派出快速的军舰突击，然后迅速派出主力战舰靠近并等后续船队，倭军的这种战术正中了李氏朝鲜全罗左道水军节度使的圈套。
也让李氏朝鲜水师以鹤翼阵将接近的倭军舰队包围住，舰上炮火从各个角度将被围的倭军舰队摧毁。
战斗也从早上一直打到傍晚。
其中幕府水师第三军中务少辅的三位主要领兵指挥官，幕府胁坂左兵卫、幕府渡边七卫门，两人阵亡，幕府真锅左马允在船上无奈切腹自尽。
又在丧失了59艘战舰后，幕府水师第三节中务少辅才开始了撤退，李氏朝鲜水师获得了大捷。
事后李氏朝鲜全罗左道水军节度使，在「见乃梁破倭状」中，宣称击毁的倭军舰队为；大船36艘、中船24艘、小船13艘、击破船数31艘。
9月13日，大明建州左卫军民指挥使：爱新觉罗·努尔哈赤（佟努尔哈赤），趁着大明帝国调兵抵抗入侵李氏朝鲜王国之际，就打着大明建州左卫官职的口号，来稳定女真各部，再加上他已经改姓（佟）用假名字。
就算光明正大的派出军队去攻打女真各部也不会被朝廷所怀疑，哪怕是女真内部仇人，也很难猜到，是谁灭了他们的部落？
故此明建州左卫军民指挥使就利用这个假名字，率兵前去东征攻打长白山女真各部，打算彻底统一起来。
这让海西女真叶赫部东城贝勒：纳拉·纳林布禄、叶赫西城贝勒：纳拉·布寨，特别不满意！毕竟之前两家有过联姻，而且如今建州左卫的势力不断扩大，作为姻亲却没有得到半点好处！
故此他俩就飞鸽传书，联系了哈达女真部贝勒：纳拉·猛骨孛罗、乌拉女真部贝勒：纳拉·满泰之弟：纳拉·布占泰、辉发女真部贝勒：纳拉·拜音达里。
同时又联合了长白山女真两部的朱舍里部女真、讷殷部女真，在加上漠南蒙古科尔沁部、锡伯部、卦尔察部，三支部落一共组成了「九部联军」，以叶赫女真部为主指挥共有3万人，分兵三路旌旗若现，浩浩荡荡的直扑建州女真军民左卫佛阿拉城而来，准备向建州女真左卫军民指挥使司发动进攻。
九部联军浩浩荡荡袭来之事，很快就被建州女真左卫的侦查兵们发现，他们第一时间就跑去，向坐镇在原大明奴儿干都指挥使司阿速江卫地区禀报情况。
得知后方老巢即将被围，他迅速做出反应撤回本部兵马全力南下，绕过讹答剌卫走潭州站、费儿忽站，途径虎儿文卫回到建州左卫军民指挥使司，在派出前锋铁骑去侦查。
回来才得知情况，发现敌军兵力从四方八方行军而来，这让明建州左卫军民指挥使开始害怕了起来，长期的对外征战自己也损失了不少士兵，虽然扩大了地盘，但自身也受到了伤害，再加上敌军人多势众，自己根本就不是他们的对手！
而且一联想到后果那就是，自己还曾与姻亲叶赫女真部有过节，要是战败免不了被杀，整个建州左卫军民指挥使司将被屠戮，如今他们联合军队，那么自己也可以向朝廷借兵求助。
于是他连忙写信一封，让士兵快马加鞭带出城去，打算交给明抚顺守御千户所游击将军：李永芳，因为之前入朝进献贡品时与此人有过接触关系不错。
因此想让他去通知明辽东巡抚兼都察院右副都御史：尤继，求救毕竟自己也算是朝廷的从三品武将，辽东都指挥使司方面的官员不可能见死不救！而且自己还为边疆立了战功。