这个举动很快被城外的流寇们探查到了，连忙向顺军左营制将军汇报道“报、启禀左营制将军在西城门口发现有明军将领逃走？”听到明军弃城逃跑的消息，顺军左营制将军当即做出决定，就趁着城门未关闭之时一鼓作气冲杀过去，少数未撤离的守城明军们见状连忙跑去关城门，但为时已晚敏捷的顺军轻骑兵迅速冲入城内，以强弩射倒城门口的明军攻入城内。
紧接着孙督师也开始布置防御，他指着潼关卫战略图说道“秦州卫总兵听令命你速带兵驻守东门、固原卫总兵听令命你速带兵驻守西门、临洮总兵听令命你速带兵驻守南门、榆林卫总兵听令命你速带兵驻守北门，其余将领随本督去南门迎战流寇，全军出发。”
安排好防御之后正门（南门）的吴俊振已经与流寇刀牌手近战短兵相接了，他连接挥刀砍死数十人又用风火震天雷炸死六个登城的流寇，马维也用长矛挥刺死五个敌人打死一个流寇，身边与其并肩作战的明军越来越少！眼看就要被流寇围住俘虏了，马维在用长矛绊倒一批流寇之后便跑向吴俊振身边拉着他说道“吴兄，眼下局势对我军不利！还是赶快退守城内吧？否则咱俩随时可能被流寇俘虏啊！”
但倔脾气的吴俊振说什么也不肯撤，还推开马维又继续冲向流寇士兵，麻利的挥刀又干掉四个流寇，正巧被登城的顺军中营制将军发现，他快速拉弓架箭射了过来，（嗖）的一下箭镞射中吴俊振挥刀的手臂！佩刀瞬间掉落在地。
吴俊振紧紧捂住手臂依旧用脚踢着冲过来的流寇，还好被马维用长矛甩倒挥刀的流寇，刺死两个领头的流寇部总，并扶着吴俊振往城内撤退，就这样新顺王传令大军火速突破城门，机灵的马维为防流寇追击过来，他特意在城中走街道绕进死胡同里成功躲过流寇士兵们的追杀，而吴俊振的手臂还在流血，马维就立刻想到了赵大夫与吴大夫能医治小伤，便扶着他绕过街道上的顺军进入赵大夫的医馆里面。
正在抓药的赵大夫见到马维搀扶着受伤的吴俊振过来，便走去门外四处望了望看看有没有人追过来？然后就关上门挂着停业牌子，并走过去问道“吴千总大人，您这是怎么了？”马维帮忙解释道“流寇已经杀入城中了，我们在守城抗击之时吴兄不幸中箭！还请两位大夫速速医治。”
吴大夫见状小心翼翼地拿起手臂看了看觉得伤口不是很深，便伸出手轻轻按住手臂拔箭，只见拔出来的箭头是月亮形的，吴大夫立刻去拿药箱过来在伤口四周涂抹上药并把手臂包扎了一圈，在对他说道“吴千总大人，您这只手臂上的箭伤好在没有毒，而且处理及时否则以铲子箭头的威力是很容易被感染的！”
处理好伤口之后吴俊振担心流寇会伤及吴大夫与赵大夫就提议保护他俩杀出去，但又不知往哪里突围？关键时刻吴大夫突然想到了一条能通往城外的路，这是他之前在调查疫情时得知的偏僻小路杂草丛生，目测暂时没有流寇会发现这条路？
此时新顺王的大军相继杀入城中，还没等明将们赶到城门口抵抗四门就以被攻破！明军士兵们急忙跑去传递军情在街道上就碰见了孙督师，便奏报道“启禀督师大人，四门以破！流寇大规模扑杀进来恐怕潼关卫是受不住了！还请督师大人速速撤离到潼关备御千户所暂避锋芒。”绝望的孙督师紧握佩刀仰天长叹道“老天爷你有负于我！李贼本督与你誓不两立。”说完就被明秦州卫总兵与众将们拉着往东门杀出，使得城内未撤离的守军全部被流寇一一杀光，就连张尔猷也在混乱中因抗击流寇而被杀，顺军权将军还带兵把粮仓与库房洗劫了一遍看看有没有什么留下来的物资？
新顺王则第一时间进入卫指挥所里查看情况，只见屋内空无一人，废弃的账簿落满一地整体看上去狼狈不堪！顺军士兵们抓到几个被俘明军便带着他们来到新顺王面前，新顺王抓起一个士兵问道“孙传庭到哪里去了？”惊恐的士兵回答道“督师大人，往潼关备御千户所方向逃去了！”得到这个情报后新顺王并没有趁机追杀毕竟天色已晚，他只好下令士兵们就地扎营用膳，也方便清点好城内物资整顿兵马在去追击。