京城周边的士绅百姓怎么也想不到，在清军退出关外，他们以为已经太平无事的时候，他们却突然被抢了，而抢劫他们的，正是赶来勤王的明军。
事情还要从孙传庭和孙元化所部来到京郊说起。清军北退之后，二孙所率的陕西、山西兵马一路尾随他们北上。一来此时的清军仍有不弱的战斗力，明军正面对战不是他们的对手，二来清军现在就是一尊移动的瘟神，谁敢招惹。因此他们只进行了几次小规模的袭击。
清军退出关外之后，孙传庭和孙元化将军队驻扎在京郊，进京面见皇帝。一开始聊得还挺好，但很快，崇祯和孙传庭就谈崩了。
孙传庭坚持认为，之所以此次战役打成这样，都因为高起潜、刘宇亮、陈新甲畏敌避战，要求严惩这三人。最要命的是，孙传庭所列的罪状里，还有这三人“久有议和之心”。
孙元化冷汗都下来了，到底是谁久有议和之心你心里没数吗？而孙传庭虽然不赞成议和，却也主张先消灭闯军和张献忠、罗汝才，因为他觉得清军还是最强的。当崇祯表示希望让孙传庭担任保定总督，调秦军长驻直隶，拱卫京师，孙传庭表示直隶、山东、山西、辽西的驻军已经够多了，是因为用了高起潜这样的人才挡不住清军，不应该再抽调内地战场本就不太够用的兵力。
话不投机半句多，崇祯把孙传庭和孙元化打发走了，孙传庭驻守易州，孙元化驻守通州。秦军的纪律自然不怎么高明，虽然还没有杀人放火，但是偷鸡摸狗、勒索财物、调戏妇女、打架斗殴的事情不少，于是保定府学教谕尹三聘便举报孙传庭纵兵劫掠。
孙传庭一直是个容易钻牛角尖的人，他和卢象升交情不深，但卢象升的死还是让他非常愤怒，认为国家就是坏在高起潜这等小人手里。再加上和崇祯聊得不愉快，回到易州不久他就病了，急火攻心，以致双耳暂时失聪。
孙传庭原本就不想当这个保定总督，于是上表说自己身体不行，请皇上换人。最近的事情加上之前陕西士绅雪片般弹劾孙传庭的奏章，还有高起潜、刘宇亮、陈新甲等人的辩解，崇祯对孙传庭已经很不信任了，他派御史杨一儁去调查孙传庭是不是真病。
杨一儁去了一趟易州，回来报告说孙传庭确实病了。崇祯又又又大怒，认为杨一儁一定是包庇孙传庭，将杨一儁革职，派锦衣卫到易州，将孙传庭抓入天牢。
秦军将领全都蒙了，这是什么意思？杨一儁要是报告孙传庭是假病，那就是孙传庭欺君，杨一儁要是报告孙传庭是真病，那就是他们两个一起欺君，合着您老人家坐在皇宫里掐指一算都算好了，认定孙传庭是装病，那你还查个六啊！
如果是另一时空孙传庭带来的那些将门世家出身的秦军军官，他们还能保持镇定，毕竟皇上干这事不稀奇，这种事也不是一回两回了，可现在孙传庭率领的，是招安时间还不长的流寇。
小红狼孙天福战伤感染而死，杨秀头、刘忠死于天花，现在乱世王郭应聘、满天星高汝利、一秤金牛成虎、黑煞神李茂春四人成了这支总数约三万人的军队的实际控制者。孙传庭能力很强，所以他直辖的抚标里没什么重要将领，孙传庭一被下狱，高汝利立刻就控制了抚标。