C3剧情开始！首先开始的是《凯恩之怒》的剧情。()
七年时间过去，这些年间，中国的发展更上一层楼，经济上高度发达，可以称得上民富国强。如今中国的人口达到七亿多，比十年前增长了差不多一亿，而人均年收入竟然高达24.8万华元！嗯，这个数字是什么含义呢，举个例子，现在中国的汽车（电动）已经不是什么高端货了，一辆相当高端的家用轿车也就两万华元，中低端的只需数千华元，拥有汽车并不是什么了不起的事情，现在中国人都以拥有小型飞行器为荣。一架“小鹰”型垂直起降飞机，乘员6人，航程2000公里，最高时速可达900公里，可在摩天大楼顶部的停机坪降落，也可在专门的垂直起降机场，甚至在自家庭院降落。有了这种飞行器，就能在全国大城市间自由往返（中途可能需要加燃料），是一种身份的象征。这种飞机的价格是168万华元，中产阶级家庭可以负担得起，而在西方这样的飞机售价高达1000万美元，只有富豪才买得起！要知道，GDI的人均收入不过4到5万美元，只有中国的七分之一！
中国已经有一套完整的空中交通规则，个人飞行器在城市间不断穿梭，这是司空见惯的事。有些富豪甚至购买GDI的“公牛”运输机！嗯，实际上这不是GDI军方的公牛运输机，而是云龙公司生产的公牛型豪华客机，外形和GDI的载重数十吨的公牛运输机一模一样，有点恶搞的趣味。常有西方人来到中国，并看到天上的“公牛运输机”飞来飞去，心中顿时有一种苦涩的感觉。在自己国家视为宝贝的战略运输机，在中国却只是有钱人的玩具，可见中方对GDI的宝贝不屑一顾，人家有高级得多的东西！
军事上，中国虽然低调，并不穴手国际争端，除了第一艘鲲鹏高调展示了一次，之后就深藏不露，再也没公布过自己的军事实力。实际上，刘云四人利用息壤，果真按计划制造了五艘新的鲲鹏，现在总共拥有六艘鲲鹏，但并未部署到全世界，只有一艘在印度洋镇守，一艘在西北太平洋，中国自己的家门前镇守，其余四艘都深潜海底，正在建设海底城市。
武器方面，刘云研究了新的激光技术，已经取得一些进展，但还没达到大规模应用的地步。这种激光技术就是——X射线激光武器！
实际上，X射线激光早已在二十一世纪第一个十年中出现，但那种X射线激光强度很弱，激光器则是自由电子激光器，总之还远远没到武器的级别。当时人们用这种波长在1纳米以下的激光来轰击原子中的电子，把电子一个一个地剥离出来，剩下裸露的原子核。这是一个很有趣的实验，但实用价值不高。而且，当时的X射线激光器需要加速器来泵浦，根本就不实用。
现在，刘云的X射线激光的能量来源是高能核，用转换核来泵浦。因为夸克机器人中，高能核储存能量，而转换核能将高能核的能量转移到数十甚至数百个电子上面，这种状态的电子就可以利用，使之产生受激辐射，即激光。由于高能核的能量很高，所以刘云研制的小型X激光武器能量比以前提高了100倍！以前的常规激光武器，单个激光器有能量限制，最大只能做到80亿焦一次辐射。后来有了改进，也只能做到激光持续发射而已，能量并未提升。当时若要提高激光炮的能量，只能用多个激光器形成阵列，这也是无可奈何的事情。
如今的X激光器，所发射的X激光波长为0.1纳米，单光子能量为12.4KeV；与之对比，旧的激光武器采用450纳米的紫光，单光子能量为2.76eV，相差了4500倍！所以刘云现在是靠提高单光子能量来提高激光炮能量。现在这种X激光武器还比较小，刘云的目标是制造一种超大型X激光炮，装载鲲鹏上面作为主炮，这样才勉强拥有星际战舰级别的主战武器（离子炮永远也无法成为主战武器）。这一技术还在研究之中，没有那么容易突破，所以X激光武器也尚未应用到军队中去。
X激光除了军事用途，在科研和民用上也有很多应用，或者说更有价值。当然，民用的X激光自然不是强光，而是弱光，最好弱到不伤害人体。而且，科研用的X激光应当有很长的相干长度，目前0.1纳米波长的X激光相干长度可达100公里！这就要求X激光的波长变化范围不超过一千亿分之一！嗯，这是很高的技术要求，不过对刘云他们来说轻而易举，毕竟他们的技术对原子与原子核的掌控能力已经极高，器件的精度早已达到原子级，现在到了原子核级别。而且，弱激光达到这么长的相干长度要容易得多，强激光就困难了（激光武器的激光在谐振腔内不反射，一次性出去，相干长度通常不高）。不过，一般强激光不需要什么相干长度，甚至单色性要求都不高，只要求能量。道理很简单，武器只有能量高才能摧毁敌人，至于测量到0.0001纳米之类的要求就没必要了，那是科研用的。
科研上，X激光就不止像普通X光那样对物质衍射，探测物质结构了，因为这时候X激光相干长度很长，单色性极高，已经可以直接给物质的原子照全息图像！以前的X射线衍射，只能得到N个衍射峰，然后经过复杂的计算、拟合，最后才能得到一种物质的结构，而这种物质只能限定是晶体，对非晶体、准晶体之类就没法得到多少信息了。而且，普通X光衍射也没法看清楚所探测材料的缺陷等结构，而科研上十分需要知道材料里面到底有什么样的缺陷，缺陷都在什么位置，什么方向，普通X光衍射却只能得到很粗略的信息，这怎能不让人心急？现在好了，有了X射线激光，两束相干激光这么一照，得到干涉图像，经过处理后立即得到放大的实时全息图像，原子的图像就这么立体地显示出来，整个样品的物质结构就这么一目了然！
另外，还可以制作这样的X激光扫描仪：就像扫条形码一样，刷的一下，需要的信息全出来了，图像也扫了出来，方便快捷！这有点未来科技的样子了，未来科技要看一样东西不就是扫描、扫描、再扫描吗？
其他技术方面，引力理论的研究已经相当深入，但反重力技术的研究碰到了瓶颈，主要问题是没有可参考的物质，整个地球，整个太阳系都没有半点反重力物质，这叫人怎么研究？嗯，或许思金人来到地球后这项研究会有突破。空间技术方面也遇到了瓶颈，这里指的是虫洞技术，理论太深奥，而且还不完善，又没有参考物质，要取得进展很难。当初系统给的“引力波和暗物质理论”里并未涉及到这些东西，而要凭空创造一个理论是不可能的，除非有充足的实验依据，现在就是没有实验，根本没辙（吐槽一句，现在流行的“超弦理论”就是这样，没有实验，任何理论都是扯淡）！总之，刘云他们的科技研究已经到了瓶颈了，需要一个契机才能突破。
平静了十年，GDI除了对中国有所警惕之外，对其他势力都放松戒备了，而中国的对外政治军事动作也沉寂了七年，只有经济交流，所以GDI的警惕也渐渐放松下来。至于Nod，现在就像一只潜伏在阴影中的毒蝎，正高举着剧毒的巨螯，准备对GDI发动致命一击！
对于处在这个时空的七位玩家而言，最近几年确实发生了一件大得不得了的事件——系统对这个时空的掌控加强了，很快就要重新触发剧情——第三次泰伯利亚战争！
2046年10月15日，塞尔维亚的萨拉热窝市中心，一座高达两百米的巨大建筑矗立在那里，这座巨大的暗红色建筑，就是目前Nod的象征——大神宫。大神宫不仅是Nod的统治中枢，更是Nod信徒的精神支柱，第二次泰伯利亚战争之中，大神宫被毁，无数信徒伤心欲绝，而如今大神宫再一次耸立在东欧的土地上，信徒们都高呼万岁。
萨拉热窝，如今已经成为一座彻头彻尾的军事城市，以大神宫为中心，整个城区连同防御城墙构成一个戒备森严的军事基地，Nod在此屯集重兵。大神宫不仅仅只有地面的部分，其地下别有洞天。
大神宫的地下，一台巨大的中央电脑即将启动，中央电脑之中，全新的战略指挥AI——Legion，即将苏醒。此时，Legion的控制台前站着一个身材丰满的女人，嗯，西方人眼里的金发美女，不过在中国人眼中是相当丑的了。这个女人就是近几年间崛起的Nod女指挥官——爱丽莎女修士长。Nod还有另一名能力出众的女指挥官——基莲，现在已经是将军了。基莲在十年多前的澳大利亚之战中立下功勋，然后迅速晋升，当初她还在马修的手下，也算是刘云的部下，但刘云并未给她多少帮助，她今天的职位大多是自己努力的结果。不过，基莲曾在马修的部队里见识过如何快速建造基地，如何快速生产，学到了一些东西，如今基莲的部队主要部署在澳大利亚，军事基地很庞大，生产能力仅次于东欧的Nod总部，可谓兵强马壮。
此时，爱丽莎启动了电源，Legion进入启动程序。
“Boot，Standby！”庞杂的数据流在Legion的智脑中运算着，已经经过凯恩精心设计、改进的智能程序Legion苏醒了！苏醒之后Legion的第一个动作就是扫描周围出现的人和事物，第一时间内它就注意到控制台前的这个女人——爱丽莎，并将她的特征全部记录下来。