大林寺以武学出名的堂口，主要是罗汉，般若二堂。
罗汉堂精研诸般外门武功，练的是硬桥硬马的刚猛路数，以大力金刚掌、普门杖法、左右穿花手、大林风云手、闯大林三十三路神拳闻名。
般若堂则专精由内而外的内家绝技，练的是听劲发力的机巧路数，以般若禅掌、须弥山掌、韦陀掌、神掌八打、千手如来掌、散花掌等闻名。
一般人拜入大林，便是在罗汉、般若二堂学武，先学基础的罗汉拳、罗汉棍、金刚掌、韦陀掌，基础打好之后，再学进阶的波罗密手、紧那罗王棍、大力金刚掌、般若掌等功夫，等进阶功夫练好，这个人差不多入寺十年，便可以去闯木人巷和铜人阵，闯过之后便算是出师的大林寺弟子，可以去山下闯荡了，这些人在山下各地建功立业，少不了大林寺的支持，反过来，这些人也为大林寺提供支持和反哺，算是一种良性发展。
进阶功夫练好，不想离寺闯荡，还想继续修行高深武功，那就不能待在俗家了，必须剃度，成为真正的和尚，然后便可以正式加入大林寺各个堂口，学习各堂口真正的高深武学。
武学圣地就是武学圣地，大林寺哪怕是戒律院、药王殿，都有自己的高深武学传承，戒律院的龙爪擒拿手、慈悲刀法，药王殿的寂灭爪、伏魔铲、大文殊杖法等等，虽然在外面名声不显，在佛门内部却也是大名鼎鼎。
各个堂口除了高深武学传承，还有各自的职司，比如罗汉、般若二堂要指点新入寺弟子练武、戒律院要维持寺内治安，还要追缉判僧，药王殿要负责全寺的药物调配，菩提院要参禅打坐，器械院要生产各式佛门兵器。