“什么？‘哥斯拉’被击退了？被初号机？我？”
当都只是听到羽戊良被击退，还是他驾驶的初号机击退时，他脸上充满了震惊和懵逼，因为他根本不知道整个过程发生了什么，稀里糊涂变成了拯救第三新东京市甚至世界的英雄。
不管怎么说，羽戊良以及第五使徒的危机被化解了，最大的功臣就是碇真嗣和初号机。
虽然无法确定初号机是否会再一次暴走，但是对于人类来说，这或许是唯一也是最后的“王牌”。
在经过一段时间的观察后，确定碇真嗣没有危险后，NERV撤销了对碇真嗣的隔离，重获自由之身。
之后经过很长时间的平静期，初号机已经完全修复完毕，而零号机已经头部问题，需要更久的时间。
难得的悠闲时间，碇真嗣去到绫波丽的住处，发生了一些羞羞的事情，相互之间增进了一下感情，为将来打好基础（？？？）！
（这一段的剧情作者君就不水字数了，有兴趣的小可爱可以去看看《福音战士新剧场版：序》，另外在百科上面大致看一下有关EVA整个世界的设定等等，本书不赘述了。）
使徒的入侵或许会迟到，但绝不会缺席。
“监视对象侵入小田原防卫线！”
NERV指挥中心，监测员报告了使徒入侵的情况。
“未确认飞行物体分析完成……”
“模式为蓝，确定为使徒！”
“这次，果然是第六使徒啊。”
冬月耕造与碇源堂一起出现来到了指挥中心，看着屏幕上显示的画面，开口道。
碇源堂依然是那副冷漠的样子，伸手扶了扶眼镜，下令道：“嗯，派初号机出击。”
碇源堂丝毫没有在乎碇真嗣那次因为初号机暴走后的情况如何，在第六使徒到来的时候，毫不犹豫派出初号机进行迎敌，在他眼里，碇真嗣或许就是一名适格者而已。
对于NERV总司令的命令，所有人都必须执行，包括葛城美里。
在一系列的准备工作完成后，当第六使徒入侵到芦之湖上空时，葛城美里下达了初号机的出击命令。
“嘟——”
正当初号机在轨道上升的时候，能量检测器有了反应。
“这是，目标内部有高能量反应！”
“什么！？”
葛城美里大惊失色，这完全是被第六使徒摆了一道，对方打算先发制人。
“难道是……”赤木律子看到过类似的高能量反应，没错，就是羽戊良释放原子吐息前的现象。
“快躲开！”
葛城美里慌张地朝碇真嗣喊道。
“蛤？”刚刚被送上来的碇真嗣一脸懵逼，根本不知道接下来要发生什么。
……