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九月，朝廷遥封远在幽州的幽州牧兼太尉刘虞为大司马上公之位，董卓由司空改任太尉，兼领前将军，加节，赐斧钺、虎贲，更封郿侯。
然后董卓联合司徒黄琬、司空杨彪一同携带鈇锧到朝堂上书，要求为建宁元年九月政变时被诬陷为叛贼的陈蕃、窦武以及次年在“第二次党锢”中被捕遇害的众多党人平反，刘协准奏，恢复陈蕃等人的爵位，并提拔他们的子孙为官。
这件事情对周晔和贾璜倒还是有利的，因为他们的妻子分别是窦武和陈蕃的孙女，这也算是为她们彻底恢复了名誉。
董卓亲近周毖、伍琼，原大将军府官员何颙、郑泰也成为其幕僚，董卓在幕僚们的建议下，亲近士人，征召名士入朝为官，比如荀爽、韩融、陈纪等人都被他征召了。
而远在交州的刘陶、郑玄、蔡邕也成为了董卓的征辟对象，不过他们三人对董卓的倒行逆施都十分愤怒，又岂肯接受他的征辟？他们不但没有接受董卓的征辟，反而写了文章，公开发表，愤怒的斥责了董卓。
同时，董卓又选拔大量名士担任地方太守等要职，比如韩馥、刘岱、孔伷、张咨、孔融、应劭、张邈等等，甚至不计前嫌，对厌恶自己而弃官而走的袁绍、王匡、鲍信等人授以太守，以示和解。
这是因为董卓不是士族出身，而只是一个武夫，并不被士族所尊重，可是他又渴望得到士族的尊重，因此，在他掌控了朝政之后，他反而开始讨好这些士族，为他们授官。
可笑的是，这些名士得到了官职之后，反而一个个都反对他，后来讨董的关东十八路诸侯里，这些人的名字大都在列。
在无人约束的情况下，董卓开始胡作非为，十月，董卓趁着何太后遗体下葬的时候，开启文陵汉灵帝陵墓时，使人偷取其中珍宝。
董卓仗着军权的威势，放纵士兵在雒阳城内劫掠富户，搜刮财物，奸女。
十一月，董卓自拜相国，有“入朝不趋，剑履上殿”的特权，自此董卓在朝廷中的权势已经如日中天。
董卓又封自己的母亲为“池阳君”，设置令、丞。
董卓性格残忍，好用刑法立威。侍御史扰龙宗拜见董卓时忘了解除佩剑，董卓借题发挥，下令将其活活打死；又指使人将何太后的母亲舞阳君杀害，甚至将何苗的遗体从坟墓中挖出来肢解扔在园林之中。大司农周忠的儿子周晖听说雒阳变故，故至雒阳，董卓非常厌恶他，派兵将其劫杀。
张扬、曹操、卫兹等人都在地方招兵买马，试图对抗董卓执政，东郡太守桥瑁甚至伪造三公文书散发到各地州郡政府，陈述董卓罪恶，呼吁各地起兵反董，恢复刘辩的帝位。
初平元年正月十二日，董卓使弘农王郎中令李儒毒杀刘辩，以断绝桥瑁等反董联军的政治企图。