并且预言了未来的第二次冲击以及人类将来某一天能打败所有由亚当与莉莉丝孕育出使徒，人类与这些使徒都会归还本体，融合成为新形态的超级生命体，并引发第三次冲击，消灭现存所有生命。
联合国决定封死无名古卷，反对使徒回归亚当引发第三次冲击，因为那会让人类也毁灭。
而因为无名古卷又诞生了另一个组织，曙光基金会。
曙光的理念则是人类之间充满了隔阂与矛盾，人与人之间彼此永远也无法互相理解，最终一定会导向自我灭亡。
人类本身的存在是不完美的，无论是肉体还是灵魂都太过脆弱，非常容易受到伤害，人与人心灵的世界是彼此隔绝的，要使人类向更高的领域进化就必须使人类的心灵摆脱躯体的束缚。
重新回到人类的诞生之地――莉莉丝之卵中，唯有如此才能最终拆除人与人之间的心灵壁障，使不同的心灵世界能相互补充，成为一个完整的完美的生命体，走向进化的终点。
所以他们制定人类补完计划。
2025年，曙光在南极发现了沉睡中的第一使徒亚当，导致亚当苏醒并释放出力量，释放反a.t立场，引起了南极地区的大爆炸，并使之变成了红海。
海平面上升，地球偏转，大部分地区气候发生剧烈变化，人类一般的人口死亡，这次浩劫被称为第二次冲击。
同时还唤醒了所有沉睡中的使徒。
自此曙光基金会的人类补完计划正式启动。
曙光将亚当还原为胚胎，以此制作亚当与莉莉丝的复制品――天鹰座战士，ofbatant，简称aoc。
并在aoc表面覆盖装甲与拘束器，假装成用高科技制造出的机甲，误导联合国和所有人类，并以之对抗使徒的侵袭，保卫人类，阻止其他使徒找到亚当胚胎与之融合。
毕竟人类自身作为第十八使徒与其他使徒也是竞争关系，谁先融合亚当与莉莉丝谁就能成为完美的终极的生命体。
就是在这样的背景下，主角与其伙伴等被选中的少年驾驶着aoc零号机、初号机、二号机及三号机与使徒对抗。
等消灭了其他所有竞争对手的使徒后，再让几架亚当与莉莉丝的复制品aoc融合，融入莉莉丝，打破人与人之间的隔阂与壁障，将全体人类化为橙汁，融为一体成为完整的第十八使徒。
人类再以第十八使徒的形态融合亚当，集齐智慧之果与生命之果，进化为终极生命。
表面上是热血漫的架构，底色却是黑深残。
“这是动画中的《黑镜》啊，尼玛大结局消灭全人类？”
“虽然是有点变态，但是好像又有点道理？”
舍友们听完刘航的简单介绍，都不禁啧啧称奇，这个人类补完计划初听起来有些变态，但又有合理之处，而且似乎还蕴含着一些哲理。
电脑屏幕上，唯美又有些意识流的大结局继续上演。
初号机作为承载人类补完计划的载体，作为驾驶者的男主角阴差阳错下拥有了决定人类是否要“补完”的决定权。
伙伴们在“人类补完计划”的阴谋中牺牲死亡，遭到了从前被他尊敬的包括父亲在内的人们的背叛，这些让少年对人类极度失望。
在这样的失望下，他选择了执行“人类补完计划”，打破所有人的a.t立场，即心之壁，发动了第三次冲击，使人类化为最原始的生命浓汤，所有的意识，所有的思想融为一体，合而为一。
人类，这个第十八使徒，终于在生命之海中获得了完整。uu看书
这里是一个没有心之壁，也没有自己形体的世界。
是一个不知道哪里是自己，哪里又是别人的世界。
是一个不知道何为自己，何为他人的世界。
也是一个没有了互相伤害，互相背叛和互相恐惧的世界。
但少年却又觉得这并不是他期望的世界。
“如果你想再次期望他人出现，那么心之壁会将人类再次分开，人与人之间的隔阂将再次产生，对他人的背叛将再次发生，对他人的恐惧又将重现。”
“没关系……人或许会互相理解，不过那都是装给别人看的，这都只不过是我的一厢情愿，不可能一直持续下去，总有一天我还会被人背叛，被人欺骗，被人抛弃……
但没关系，我还想再见一次我的朋友，我的父亲，还有那些我并不认识的陌生人……
不管人与人之间会发生什么样的伤害、欺骗或者利用，但那一刻的爱是真的，快乐的痛苦的心情是真的。”
在激昂的音乐中，身为所有人类的载体，aoc初号机冲破了亚当与莉莉丝融合巨人的眼球。
在刘航的瞠目结舌中，此刻的少年就彷佛是人类的化身，代表了人类在决定人类命运十字路口，选择回到了那个不完美的，无法互相理解的世界。
整部动画的前十九集每个角色都努力弥补自己的创伤，努力寻找自己缺失的东西，就像人类补完计划一样。
但最终人类还是选择了接受不完美，接受隔阂，并相信那份真实的美好。