在消灭严查彪部之后，我利用游击战法消耗张宇新的实力，并最终在会战中取得胜利，占据紫云基地。
我劝说宁泽武与我联手，消灭了南方的咆哮体霸主和铁甲体巨人，并收到了尚宫巧莹的求援。
鲁亿发与我再次并肩而战，金毛犬王的孩子金狮也成长为足以担任坐骑的猛兽。
鲁亿发与我在紫云山修炼，这期间我找回了伤愈的李晓武，击败了几波想要抢夺紫云山的人类强者。
尚宫巧莹与新晋的女变异体蛇女爆发终极一战，蛇女企图掌握号令天下的大权，危急时刻李晓武赶到，助战尚宫巧莹击杀蛇女，而此时人类高层计划将大量变异体引到印度，用核弹毁灭它们。
在尼罗河地区兴起的复活法老王哈苏在几年时间里已经收服了整个非洲的变异体，并且东征消灭了中东地区的幸存者基地，我与宁泽武丧尸集团在印度大战东征的哈苏女王，印度成了核战的牺牲地，数以百计的核弹将这里化为人间炼狱，最后的大海啸淹没了印度三分之二的地区。
宁泽武和哈苏女王双双陨落，李晓武为了救我而被核弹毁灭，我侥幸逃过一劫，愤怒之下独自前往欧洲大开杀戒，最终不敌被擒。
我被关押在改造人监狱，旧政府人类高层想要将我的意志抹除，改造成杀人机器为他们所用，此时外星文明派出机械战士进攻旧政府基地，我意外被当做外星文明的机械战士而被外星文明派来的援军救出。
外星文明培养的第一批机械战士在此战中表现不佳，伤亡惨重，第二批黑暗特工数量稀少却实力强劲，我结识了黑暗特工zero，她是78星人与其他种族的混血儿，是第二批黑暗特工的首领。
第一批机械战士的佼佼者韩必不甘居于zero之下，他似乎知道我的身份，蛊惑我参与谋杀zero。韩必知道旧政府基地的改造人突袭计划，却没有上报给zero，自傲的zero被诱骗到改造人突袭的地方，力战而死。
韩必成功上位，我则趁机偷偷跑回华夏。
韩必在zero的尸体碎片上找到了她的复制信息，黑暗特工的复制体error，这是一具缺少自主意识的复制体，完全受到韩必的掌控。
回到华夏后，北方一波变异体狂潮趁着南方空虚涌入，其中竟有我先前的坐骑，如今已是蝠翼恶魔的蝙蝠王。
见到我之后，蝙蝠王临阵反水，北方变异体狂潮战败。
此后，经过不断发展，位置南方站稳脚跟，并且找到了小红姐的消息。
小红姐驾驶机动步兵飞往了南极，南极和北极是人类最后的净土。