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penny发现了岛和父亲的秘密，从而也断定desmond很可能并没有死，而是到了岛上。
于是在desmond在航海中失踪后，penny便利用自己取得的这些信息，调动自己的资源，在北极建立磁场检测站，希望有朝一日撞大运根据磁场异常发现岛的位置（这种守株待兔监测岛的位置的方法应该也是从他爹那里偷学来的。
也正是因此，当天鹅舱内爆之后，penny和widmore都检测到了岛的位置，在penny还没来得及组织力量前往救援时，widmore就已经组织起一只以瓦解ben的力量为目的的小分队和雇佣军，抢先到了岛上。
为了取得岛上的人的信任，特别是考虑到可能利用desmond，因此widmore从女儿那里偷来penny和desmond的合影交给naomi，让naomi必要时可以通过骗desmond取得岛上相关人等的信任。
naomi进岛时出了点意外，却意外地被desmond及时找到。原因是这时的desmond成了神奇的预言帝。
这里不得不说一个《lost》隐藏的谋杀案：desmond“杀”charlie。
charlie的死当然不是desmond下手，但desmond却利用了charlie的死。
charlie之所以明知自己会牺牲却仍然下定决心潜入窥镜站，是因为desmond对charlie承诺说，他看见了claire母子最后登上了直升机。charlie听到这句话，才下定决心。但后来claire根本没有登上直升机！
desmond的承诺根本就是谎言。desmond其实只看见了自己与penny团聚的结局，而根本没有看见claire的未来。很明显的一个证据是在此之前desmond的重要预言都有画面出现，而唯独这个直接造成charlie死亡的重要预言，却没有出现过任何关于claire的画面。
所以当desmond向charlie承诺自己看见claire脱险时，他的语气是很迟疑的。而到了最后他目睹charlie的死时，流露出的表情除了悲痛多的是愧疚。
说回ben。
widmore的小分队和雇佣军最后还是顺利登岛，很大程度上瓦解了ben的权力，还杀了ben的女儿。另一方面，本来死定了的locke原地满血复活，并俨然已有了the-others领导者的架势。窝囊的是，以往被玩弄于鼓掌之间的815幸存者也成功反击，挫败ben的夺孕妇计划。ben在三条战线上同时受挫，顿时陷入人生中的最低谷。
而他此后的经历，则已陷入黑衣人“寻找loophole”计划的巨中了。
黑衣人的最终目的很简单：杀jacob、杀候选人，破除封印，离开岛。
在杀jacob还没有完全把握的情况下，黑衣人从候选人杀起。最高目标当然最好是把候选人杀光，断了jacob的后路，一了百了。但这根本办不到，因为候选人也受到封印保护，黑衣人没法直接杀他们，拐弯抹角地借刀杀人机会又太少。不过即便如此，也是杀一个算一个，每杀一个候选人，jacob接班时的选择余地变少一分。
在第六季中，黑衣人用炸加潜艇制造出一个让候选人们“自杀”的陷阱，成功地除去几名候选人。而这远不是黑衣人第一次对候选人动手。
这就又引出了其他几宗隐藏的谋杀案。例如boone和shannon兄妹的死。
boone和shannon兄妹的姓被刻在灯塔的转盘上，因此他俩本来也是候选人之一。不幸的是，他们成为最早被黑衣人借刀杀掉的候选人。
boone从悬崖摔下其实是黑衣人一手策划的。首先，boone爬上悬崖的原因是locke的腿忽然失去知觉。
用locke自己的话来说，他不知道为什么岛要把赐予他的东西拿回去了。
从815坠机那天开始，身患重疾的locke和ross就都受到岛的恩赐，病患奇迹般地康复。如今，黑衣人施法短暂拿回对locke的这种恩赐，目的就是布局干掉boone。
黑衣人通过梦境引导locke去寻找yemi的飞机，还暗示了boone将死。locke乖乖上钩，并且双腿在路上非常“凑巧”地完全失去知觉。
于是，爬上悬崖的“顺理成章”地成了boone。当boone被摔成重伤后，locke的腿非常“及时”地复原。可怜的locke愣是从来没去想过他诡异的短暂瘫痪和boone之死的关系。
之后被借刀杀掉的是shannon。shannon死前被穿越而来的walt所扰。shannon看到的walt可能有几种解释。
第一种：此时的walt正被the-others抓走做实验，穿越而来的walt肯定不是完全自由的，而是处于某种实验状态之中，每次出现一会儿便又消失。之所以出现在shannon面前，可能完全是个误会。walt可能只是因为与狗狗vi之间的情感联系而下意识地出现在了vi周围，而那时的vi恰好由shannon照顾。
第二种：这其实是shannon看见的幻觉而已。就在这不久前，claire捡到本来放在walt他们木筏里的漂流瓶，并告诉了shannon和sun，所以shannon隐约觉得walt已经落水死了！walt浑身是水的这个形象，其实是岛上的能量对shannon施加了影响，让shannon的心魔实体化的结果。所以这一个根本就不是真正的walt。“心魔实体化”也可以解释片中其他一些情节，比如：sawyer看到的一头被自己误杀者附体的野猪；kate看见她以前撞死的一匹马。
不管是哪种解释，黑衣人诱杀shannon的方法是一方面利用shannon的幻觉监视着shannon进入丛林，另一方面则是通过操纵幽魂们的whisper来绷紧anna-lucia等人的神经。
之所以说黑衣人可以操纵whisper，是显然岛上幽魂们的whisper与黑衣人有一定的联系，例如在michael死时，就是先听到whisper，然后紧接着看见christian出现。
此时shannon又看见walt。walt随后往anna-lucia的方向隐去。同一时刻，不远处的anna-lucia又一次听到whisper，神经崩溃，将追walt而忽然出现的shannon误杀。这很明显是一个诱杀的过程。两方面配合得天衣缝。
下一个被黑衣人干掉的是mr.eko。黑衣人是不能直接动手杀候选人的，只要那个人还是候选人。但是，只要候选人被“除名”，那么黑衣人就可以自己动手了。这就是他杀eko的方法。
黑衣人可以化身为在岛外死亡在尸体来到岛上的死人，因此他可以变身为eko的弟弟yemi。
变成yemi的黑衣人借yemi之口诱使eko说出了杀人不悔改的话，一旦此话出口，eko便向后来的juliet以及ben那样触犯了jacob这一方的rules（戒条，从而丧失了候选人资格。也正因此，eko此话一出，yemi便化身黑烟，将eko杀死。
以上是黑衣人杀候选人的一些例子，以下才是加困难和真正有意义的计划——杀jacob。
在第五季非常震撼人心的结尾集中，黑衣人对jacob说：“迟早有一天，我会找到一个漏洞（loophole。”
后来变身为locke的黑衣人成功潜入jacob的住处。jacob淡定的说：“看来你找到漏洞了。”黑衣人甚为得意地回答说：“我的确是”。
第五季结束时，并没有讲黑衣人找到的loophole到底是什么。第六季的剧情走向很大程度上大大偏离了解释的预期，表面上看，到最后编剧也没有交代黑衣人的loophole到底是什么。不过，其实如果仔细分析的话，还是可以从《lost》整个后半部剧情中归纳出黑衣人的这个“寻找loophole”计划的框架。
杜星河分析的结果是这样的：假如jacob这位大神的核心能力是操纵命运的话，那么黑衣人这个大神的核心能力是什么呢？
黑衣人与jacob的能力都是得自岛上的生命之源，因此乃是一体两面，黑衣人的能力，理应与jacob有共通性。jacob的能力表现得十分玄幻，而黑衣人的能力——变形之类的——则相对“物理”得多。如果jacob的核心能力是操纵命运而可以被称为“命运领主”的话，那么黑衣人呢？