三公册封结束，自然到九寺的九卿了
杨侗以‘三省九部’运作大隋朝廷政务之外，仍然沿袭汉魏以来传统，设置诸寺作为朝廷事务机构，以具体执行诏令决策，同时也是对‘三少九部’的补充，包括太常、卫尉、光禄、宗正、太仆、司农、大理、鸿胪、太府九寺，每寺设置卿和少卿各一人作为正副长官，以下分设丞、主簿、录事等官职。
九寺的九卿职权现在不大，但品级不低，皆为从三品，杨侗打算将些边缘化的‘卿’安排给忠心耿耿的大隋老臣：一是他们的年纪大了，精力不足，是到休养的年纪；二是希望借用他们的丰富经验培养新人。
新隋无宦官，杨侗从侍从手中接过圣旨，宣读道：“封王威为太常卿，授陈国公，赐田万亩、金钱三万、银钱五万！”
“微臣谢恩！”王威喜不自胜，连忙谢恩。
太常乃是九寺之首，掌管祭祀社稷、宗庙和朝会、丧葬等礼仪。祭祀时充当主祭人、皇帝助手。同时主管皇帝寝庙园陵及其所在县。下设太庙、太乐、太医、太卜四署，编制三百四十七人。
王威因为忠诚大隋，在史上被即将起事的李渊给砍了，如今应该可以寿终正寝了。他在并州之时，将李渊吃得死死的，还将晋阳宫百万石粮食、四十万套武将完好无损的运到恒山郡，断了李渊起事物资、富了杨侗；马邑战争时，也是他阻了李渊北上之路，避免了隋军南北作占，到了并州战役爆发，又立下不小的功勋，封他一个国公并不为过。
将圣旨和官印递给王威，杨侗又道：“封李景为卫尉卿，授滑国公，赐田万亩、金钱三万、银钱五万！”
卫尉为九寺之一，使命是负责朝廷仪仗、守卫武库，兼掌皇城守卫、禁军、戍卫京师，下设公车、武库、守宫、金吾四署，相当于京城军区司令部、治安局。
“微臣谢恩！”李景异常激动的拱手谢恩。他感觉这是对他李景能力的认可、忠诚的信任，是一种无上殊荣、重如泰山。
“封王琮为光禄卿，授河间郡公，兼清华学宫学士，赐田六千亩、金钱两万、银钱四万。”
光禄同样是九寺之一，主管皇城宫殿的事物，负责皇室饮食，统辖太官、肴藏、良酝、掌醢四署，手下有一百零六人。
王琮拱手谢恩：“微臣谢过陛下！”
说起来，王琮也是一个文武双全的人物，他身为一介文人，硬是让窦建德数十万大军进不了河间半步，只可惜早年不得志，黄金年龄就那样白白错过，如今老了，也该歇歇了。
杨侗很可惜这么一个大才，但也没办法改变什么，不过王琮人虽老去，一生经验尤在，依旧可以发挥余热，因为光禄卿是一个闲职，平时可以去清华学宫培养人才。
“封杨元弘为太府寺卿，平原郡公，赐田六千亩、金钱两万、银钱四万。”
太府寺主要负责国家金帛和谷物的保管出纳机构。负责皇室私用及官府手工业，统左右藏藏、左右尚方、司染、掌冶四署，编制七十四人。
“微臣拜谢圣上。”杨元弘出列道谢，
杨元弘和王琮一样，也是被耽搁掉的文武全才，不过太府寺比较繁忙，所以杨侗没有给他安排清华学宫学士之职。
“封张万岁为太仆卿，授飞马郡公，赐田六千亩、金钱两万、银钱四万。”
太仆为九寺之一，掌管皇帝车马及全国畜牧业，统辖骅骝、车府、典牧牛羊等四署，编制一百四十八人。太仆寺卿其实一直都由张万岁担任，只不地张万岁还年轻，他真正的价值是为大隋军队养育战马。若是让他来邺城管理乱七八糟皇室车马，那才是暴殄天物，因此一直都是遥领，由少卿代理一切杂务，以后依旧如此。
“微臣谢恩！”
杨侗继续宣读道：“封高君雅为大司农，授楼烦郡公，赐田六千亩、金钱两万、银钱四万。”
“微臣谢过陛下！”高君雅拱手谢恩。
司农寺负责国家仓库、林苑、市场及薪炭供应等事务，统太仓、平准、上林、导官四署，编制八十二人。高君雅以前和王威是搭档，如今年纪也到了，虽是武将，且没有多大的治军能力，但为人忠诚、细致，让他监管、审查大隋各大粮仓也算是所用得人。
“封郑仁基为大理寺卿。赐田千亩、金钱两千、银钱一万。”
大理寺掌管的是天下的邢狱，负责官吏犯罪及平民死刑的复审，编制五十七人。
每年天下的断狱总数要汇总到大理寺，疑难案件也要报请大理寺处理，大理寺也常派人员到地方处理某些重要案件，同时还主管修订律令的有关事宜。
但它厉害的职能是根据诏令，可以不通过地方官员即可逮捕﹑囚禁、审问有罪的王公大臣，相当于后世那个让贪官污吏闻风丧胆的部门。
郑仁基精通律法、刚正不阿，得到魏征和刘政会联合推荐，从而被破格提拔，只不过他在年初还是窦建德的人，在隋朝这边没立过什么功劳，所以不授予爵位，只是象征性的赏了些钱财。
转眼之间，九寺卿已封其七，只有宗正、鸿胪没有册封。
宗正寺主官称宗正寺卿或宗正卿，副官称宗正少卿，主要掌管皇帝亲族、外戚勋贵等有关事务，比如说宗室，外戚犯法，这个不归大理寺管辖，而是由宗正处理，这个有些类似于清朝的宗人府。
不过宗正一职，向来由宗室要员担任，比如东汉刘虞就曾经担任过宗正，杨恭仁在文帝时期也当过宗正少卿。