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上公：太傅，每当新皇帝即位，辄置太傅录尚书事，总揽朝政。
太傅有属吏，据《汉官》记载有长史一人，秩千石，掾属24人，令史、御属22人。
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三公。东汉以太尉、司徒、司空为三公。
太尉：掌四方兵事功课，岁尽即奏其殿最（最，表示政绩优异，殿，表示政绩下等）而行赏罚。除主兵政外，也兼管民政。太尉分领太常、卫尉、光录三卿。
其属吏有长史一人，秩千石，总管各曹事务。诸曹掾、史、属24人。在诸曹中，西曹主府中官吏的任用；东曹主二千石的迁转和任用；户曹主管民户、祠祀、农桑；奏曹主管奏议；辞曹主管辞讼；法曹主管邮驿日程期限；尉曹主管卒徒转运事；贼曹主管盗贼；决曹主管刑法；兵曹主管兵事；金曹主管货币、盐铁；仓曹主管仓谷。此外，还有黄阁，主簿录省众事，为阁下诸吏之长。又有令史及御属23人，阁下令史掌管仪仗执事；记室令史掌管上章表报书记；门令史主管府门。其余令史掌管各曹文书。
司徒：掌教化，分领太仆、鸿胪、廷尉三卿。属吏有长史一人，秩千石。掾属31人，令史及御属31人。
司空：掌水土事。凡营城起邑，浚沟洫、修坟防之事，则议其利，建其功。凡四方水土功课，岁尽则奏其殿最而行赏罚。司空主地，分领宗正、少府、司农三卿。献帝建安十三年（公元208年），改司空为御史大夫，职如司空，不领侍御史。其属吏有长史1人、掾属29人、令史及御属42人。
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九卿：以太常、光禄勋、卫尉、太仆、廷尉、大鸿胪、宗正、大司农、少府为九卿。
太常、光禄勋、卫尉三卿，並太尉所部；太仆、廷尉、大鸿胪三卿，並司徒所部；宗正、大司农、少府三卿，並司空所部。东汉九卿之长均加“卿”字，其秩皆中二千石。
一、太常，掌宗庙祭祀与礼仪。
其属官据《百官表》载有“太乐、太祝、太宰、太史、太卜、太医六令丞，又均官、都水两长丞，又诸庙寝园食官令长丞，有廱太宰，太祝令丞，五畴各一尉。”太丞令、丞，掌伎乐，国家有祭祀，请奏乐。太祝令丞，掌读祝文及迎送神。太宰令丞，掌宰牲及馔具。太史令丞，掌天时星历。太卜令丞，掌卜筮。太医令丞，掌巫医。令秩皆六百石。
太常机构庞杂，其属吏掾史有：太常掾、太常掌故、太史掌故、史书令史、待诏、大典星、治历、望气、望气佐、高庙仆射、庙郎、寝郎、园郎、礼官大夫、曲台署长、写书官等，吏员多至二千人。
博士也隶属太常，博土，秦官，掌通古今，秩比六百石，员多至数十人。初期的博士掌望气迎神和卜筮诸事。至武帝建元五年（前186年）立五经博士，专以讲授经学，宣帝黄龙元年（前49年）员额增至12人。博士的考试也归太常主持。
太史令一人，六百石。本注曰：掌天时、星历。凡岁将终，奏新年历。凡国祭祀、丧、娶之事，掌奏良日及时节禁忌。凡国有瑞应、灾异，掌记之。丞一人。明堂及灵台丞一人，二百石。本注曰：二丞，掌守明堂、灵台。灵台掌候日月星气，皆属太史。
博士祭酒一人，六百石。本仆射，中兴转为祭酒。博士十四人，比六百石。本注曰：《易》四，施、孟、梁丘、京氏。《尚书》三，欧阳、大小夏侯氏。《诗》三，鲁、齐、韩氏。《礼》二，大小戴氏。《春秋》二，《公羊》严、颜氏。掌教弟子。国有疑事，掌承问对。本四百石，宣帝增秩。
太祝令一人，六百石。本注曰：凡国祭祀，掌读祝及迎送神。丞一人。本注曰：掌祝小神事。
太宰令一人，六百石。本注曰：掌宰工鼎俎馔具之物。凡国祭祀，掌陈馔具。丞一人。
大予乐令一人，本注曰：掌伎乐。凡国祭祀，掌请奏乐，及大飨用乐，掌其陈序。丞一人。
高庙令一人，六百石。本注曰：守庙，掌案行扫除。无丞。
世祖庙令一人，六百石。本注曰：如高庙。
先帝陵，每陵园令各一人，六百石。本注曰：掌守陵园，案行扫除。丞及校长各一人。本注曰：校长，主兵戎盗贼事。
先帝陵，每陵食官令各一人，六百石。本注曰：掌望晦时节祭祀。
右属太常。本注曰：有祠祀令一人，后转属少府。有太卜令，六百石，后省并太史。中兴以来，省前凡十官。
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二、光禄勋，掌宫殿掖门户，有丞。
其属官有大夫、郎、谒者，皆沿秦制。此外，还有期门、羽林，都是光禄勋的属官。
大夫掌论议，有太中大夫、光禄大夫、谏大夫，皆无员，多至数十人。”这些都是属于参谋顾问之官，初由武士任职，后才改用文学之臣。谏大夫，秩比八百石。光禄大夫，秩比二千石。太中大夫秩比千石如故。当时朝政多下公卿、大夫、博士议论，法令政策也多由此作出。
郎，《汉书ap8226；百官公卿表》云：“郎掌守门户，出充车骑，有议郎、中郎、侍郎、郎中，皆无员，多至千人。议郎、中郎秩比六百石，侍郎比四百石，郎中比三百石。中郎有五官、左、右三将，秩皆比二千石。郎中有车、户、骑三将，秩皆比千石。”除议郎外，皆主执戟宿卫。
郎的属官还有：外郎，也称散郎或郎署长，冯唐曾任其职。车郎，主管车辆。辇郎、户卫、骑郎将、郎中骑千人等。所以郎官的数量相当多。凡在殿中为郎，常递补长吏。
谒者，《汉书ap8226；百官公卿表》云：“谒者掌宾讚受事，员七十人，秩比六百石，有仆射，秩比千石。”可见谒者除掌传达，接待宾客外，还是宫廷的守卫。有时还受临时差遣。
“光禄勋”设中郎将，秩比二千石。属官有给事期门。（五官中郎将，左中郎将，右中郎将，虎贲中郎将，羽林中郎将。东汉末还有东、北、西、南中郎将）。
五官中郎将一人，比二千石。本注曰：主五官郎。五官中郎，比六百石。本注曰：无员。五官侍郎，比四百石。本注曰：无员。五官郎中，比三百石。本注曰：无员。凡郎官皆主更直执戟，宿卫诸殿门，出充车骑。唯议郎不在直中。
左中郎将，比二千石。本注曰：主左署郎。中郎，比六百石。侍郎，比四百石。郎中，比三百石。本注曰：皆无员。
右中朗将，比二千石。本注曰：主右署郎。中朗，比六百石。侍郎，比四百石。郎中，比三百石。本注曰：皆无员。
虎贲中朗将，比二千石。本注曰：主虎贲宿卫。左右仆射、左右陛长各一人，比六百石。本注曰：仆射，主虎贲郎习射。陛长，主直虎贲，朝会在殿中。虎贲中郎，比六百石。虎贲侍郎，比四百石。虎贲郎中，比三百石。节从虎贲，比二百石。本注曰：皆无员。掌宿卫侍从。自节从虎贲久者转迁，才能差高至中郎。
羽林中郎将，比二千石。本注曰：主羽林郎。羽林郎，比三百石。本注曰：无员。掌宿卫侍从。常选汉阳、陇西、安定、北地、上郡、西河凡六郡良家补。本武帝以便马从猎，还宿殿陛岩下室中，故号岩郎。
羽林左监一人，六百石。本注曰：主羽林左骑。丞一人。
羽林右监一人，六百石。本注曰：主羽林右骑。丞一人。
奉车都尉，比二千石。本注曰：无员。掌御乘舆车。
驸马都尉，比二千石。本注曰：无员。掌驸马。
骑都尉，比二千石。本注曰：无员。本监羽林骑。
光禄大夫，比二千石。本注曰：无员。凡大夫、议郎皆掌顾问应对，无常事，唯诏令所使。凡诸国嗣之丧，则光禄大夫掌吊。
太中大夫，千石。本注曰：无员。
中散大夫，六百石。本注曰：无员。
谏议大夫，六百石。本注曰：无员。
议郎，六百石，本注曰：无员。
谒者仆射一人，比千石。本注曰：为谒者台率，主谒者，天子出，奉引。古重习武，有主射以督录之。故曰仆射。常侍谒者五人，比六百石。本注曰：主殿上时节威仪。谒者三十人。其给事谒者，四百石。其灌谒者郎中，比三百石。本注曰：掌宾赞受事，及上章报问。将、大夫以下之丧，掌使吊。本员七十人，中兴但三十人。初为灌谒者，满岁为给事谒者。
右属光禄勋。本注曰：职属光禄者，自五官将至羽林右监，凡七署。自奉车都尉至谒者，以文属焉。旧有左右曹，秩以二千石，上殿中，主受尚书奏事，平省之。世祖省，使小黄门郎受事，车驾出，给黄门郎兼。有请室令，车驾出，在前请所幸，徼车迎白，示重慎。中兴但以郎兼，事讫罢，又省车、户、骑凡三将，及羽林令。
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三、卫尉，掌宫门卫屯兵。卫尉秩中二千石；设丞一人，秩千石。属官有公车司马令、丞，掌守司马门，凡天下奏事，四方贡献和征召均总领之。卫士令丞，掌守卫护从。旅贲令丞，专供奔走之役。令秩六百石。又诸屯卫侯，司马二十二官员皆在其属下。
公车司马令一人，六百石。本注曰：掌宫南阙门，凡吏民上章，四方贡献，及征诣公车者。丞、尉各一人。本注曰：丞选晓讳，掌知非法。尉主阙门兵禁，戒非常。
南宫卫士令一人，六百石。本注曰：掌南宫卫士。丞一人。
北宫卫士令一人，六百石。本注曰：掌北宫卫士。丞一人。
左右都候各一人，六百石。本注曰：主剑戟士，徼循宫及天子有所收考。丞各一人。
宫掖门，每门司马一人，比千石。本注曰：南宫南屯司马，主平城门；宫门苍龙司马，主东门；玄武司马，主玄武门；北屯司马，主北门；北宫朱爵司马，主南掖门；东明司马，主东门；朔平司马，主北门：凡七门。凡居宫中者，皆有口籍于门之所属。宫名两字，为铁印文符，案省符乃内之。若外人以事当入，本官长史为封c97d传；其有官位，出入令御者言其官。
右属卫尉。本注曰：中兴省旅贲令，卫士一人丞。
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四、太仆，掌舆马。秩中二千石，有两丞秩千石。掌乘舆并主马政，有牧师诸苑三十六所，分置北边、西边，分养马三十万头。
中太仆，掌皇太后舆马，不常置。
农官，据《汉书ap8226；食货志》记载，武帝时水衡少府，太仆，大农各置农官，专司耕种官田。此外，还有骏马监、平乐监、栘中监、厩司御和家车吏（掌汉王之家车，非军国所用。）
考工令一人，六百石。本注曰：主作兵器弓弩刀铠之属，成则传执金吾入武库，及主织绶诸杂工。左右丞各一人。
车府令一人，六百石。本注曰：主乘舆诸车。丞一人。
未央厩令一人，六百石。本注曰：主乘舆及厩中诸马。长乐厩丞一人。
右属太仆。本注曰：旧有六厩，皆六百石令，中兴省约，但置一厩。后置左骏令、厩，别主乘舆御马，后或并省。又有牧师范，皆令官，主养马，分在河西六郡界中，中兴皆省，唯汉阳有流马菀，但以羽林郎监领。
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五、廷尉，掌刑辟。秩中二千石，为最高司法官，有正、左、右监，秩千石。朝廷每有大狱，皆由廷尉审理，又有“杂治”之法，相当于后代的会审。廷尉是审判全国疑难案件的最高机构，除个别特难案件上报皇帝裁决外，有终审裁判权。
属吏有：廷尉史、奏曹掾、奏谳掾、从史、廷尉文学卒史、书佐等。
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六、大鸿胪，掌典客，诸归义蛮夷。秩中二千石，丞秩千石。掌诸王列侯与内附部族之封拜、朝聘、宴飨、郊迎之礼仪。又接待地方上计诸吏。属官有行人令、丞，译官令、丞，别火（狱官）令、丞及郡邸长丞。
典属国，掌蛮夷降者。秩二千石，置都尉、丞、侯、千人。凡边疆各族降服于汉，仍保存其国号者，称为属国。由典属国掌管其事。成帝河平元年（前28年）省典属国，并入大鸿胪。属官有九泽令，主客，大鸿胪文学，大行治礼，大行卒史等。
大行令一人，六百石，本注曰：主诸郎。丞一人。治礼郎四十七人。
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七、宗正，掌亲属。秩中二千石，丞一人，秩千石。掌序録王国適庶六次，及诸宗室亲属远近，郡国岁因计上宗室名籍。若有犯法当髡者，先上宗正，由宗正上报后执行。
属官有都司空令丞、内官长丞。都司空令丞，掌治宗室罪人；内官长丞，诸公主家令、门尉皆属之。
郡国置宗师，掌皇室宗族之散居郡国者，考察不从教令与有冤失职者，上之宗正。吏员有主傅、主府、舍人等。
诸公主，每主家令一人，六百石。丞一人，三百石。本注曰：其余属吏增减无常。
本注曰：中兴省都司空令、丞。
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八、大司农，掌谷货。秩中二千石。两丞秩千石。掌谷货，是主管财政之官。凡各地田祖口赋之收入、盐酒专卖、鼓铸的统制、平准、均输与漕运的管理，以及各地物产的调度，国家的开支等，均由大司农掌管。
属官有太仓，均输、平准、都内，籍田五令、丞，斡官、铁市两长丞，又郡国诸仓农监、都水共65名官长，丞都为其属下。騪粟都尉，武帝时掌军中财政，不常置。其他吏员有大司农史，大司农斗食属、治粟都尉（尽斡天下盐铁），农官（《食货志》载，武帝水衡少府、太农、太仆，各置农官。）稻田使者，榷酤官（昭帝始元六年罢）等。
太仓令一人，六百石。本注曰：主受郡国传漕谷。丞一人。