枋头落败成了桓温一生的痛点，为了掩饰，他把责任全推给豫州督导官袁真，指控他不能凿开石门，才使军粮不继，上疏免除袁真的官职，贬作平民，同时也免除冠军将军邓遐的官职。
外人或许真的被他迷惑了，但当事人却深知其中的原委，袁真心里不服，也上疏指控桓温，认为他指挥不利，才酿成惨剧。
这时的东晋朝廷已完全落入桓温之手，建康当局自然是无视袁真的指控，而是直接下诏书将其贬谪。
袁真更加怒不可遏，于是据守寿春叛变，并呈上降书投奔前燕，同时又派使节向前秦投诚。
桓温吃了败仗，处境固然不利，但前燕慕容垂虽帮助国家击退了东晋的侵略，仍旧难逃猜忌的厄运。
实际上，因为慕容垂立此大功，慕容暐虽对他的印象略有改观，但慕容评对他却是越发妒嫉，生怕抢了自己的风头，于是处处与他作对。
战后慕容垂奏请对立功的将士论功行赏，但慕容评担心这些人感激慕容垂，而对他死心塌地，所以把奏章搁在档案里面，不闻不问。后来慕容垂屡次请求，甚至跟慕容评在金銮殿上，当着慕容暐和群臣的面发生争执，慕容评仍旧死鸭子嘴硬，声称没有接过这样的奏章，更无理指责慕容垂的不是，慕容垂这小爆脾气哪能忍气吞声，两人险些拔刀相向。
慕容评终于动了杀心，原本只是想打压慕容垂，但现在发现自己已经完全控制不住他，若不提早灭口，一定会成为大祸。
可足浑太后也一向讨厌慕容垂，把慕容垂扫平侵略的战功，评价得一无是处，慕容评于是联合她准备将慕容垂诛杀。
已故太宰慕容恪的儿子慕容楷和慕容垂的舅舅兰建，得到消息后都警告慕容垂：“对方已准备赶尽杀绝，最好先下手为强！只要除掉了慕容评和慕容臧，其余的人都无作为。”
慕容垂虽然恼怒，仍旧不忍出手，焦虑地说：“骨肉互相残杀，而我领头作乱，宁愿一死，也不忍如此啊！”
二人不甘心，继续游说：“太后心意已定，大祸即将临头，你就算要以死明志，难道要让家族的人一起受牵连吗？你一死，他们势必难以活命。”
慕容垂黯然，想了好一会才说：“一定无法挽回的话，我宁愿出京躲避好了，其他的办法全不考虑，你们不用再劝了。”
他虽这么说，心里却也知道前途难料，内心十分忧愁，但又不敢告诉他的儿子们，成天叹声叹气，面色如土。
世子慕容令发觉不妥，问道：“父王近日面色沉重，是不是因为主上年纪还小，皇家师傅嫉妒贤才，你的功劳越大，威望越重，他就越是猜忌？”
这话一针见血，慕容垂叹道：“是啊，我竭尽全力不顾性命，击破强大的贼寇，只想保卫家国，怎么知道大功告成之后，反而连个容身之处都没有！你既看出我的困境，有什么建议？”
慕容令郑重地说：“主上微弱，把国家大权交给皇家师傅，一旦大祸爆发，势如闪电，为了保全家门，争取生存，而又不违背大义，不如逃到龙城，用最卑微的言辞，上奏请求恕罪，等待主上明察，希望他们能醒悟过来，那时得到允许再回首都，这是幸运中最大的幸运。如果行不通，我们对内巩固前代，对外结纳各个夷族，南方把守肥如要塞，用以自保，这是第二条路。”