断食排毒的过度期毒素
需要注意的是，在断食时，身体会燃烧脂肪作为能量来源，而许多沉积在脂肪组织的毒素，例如：汞、DDT等，这些毒素会突然间大量释出，进入血液循环而到达全身，因此可能会造成组织的损伤，或有人会因此而有头痛等症状出现，如果是DDT，可能会造成神经毒性。有时，体内的谷胱甘肽或其他抗氧化剂库存量不够，会导致第一阶段的产物烫手山芋四处乱窜，造成断食时好像症状恶化的现象，这个现象暂时不要紧张，会自然消退。
有些人断食前有鹅口疮，就是俗称的嘴破，断食第二天开始，原本的小破洞，反而逐渐扩大，而不是愈合，这就是体内毒素释放出来结果。另外，痛风患者禁止断食也是这个道理，断食时身体会释放大量尿酸，血中尿酸浓度增加，尿酸结晶变多，会使痛风者病症加重。所以在断食前，必须告知有经验的断食医师自己的详细状况才能进行。
断食时的生理变化
断食的时候，生理反应会有戏剧性的转变，例如：
1生命迹象（VitalSigns）减慢、血压下降、心跳变慢、体重下降。
2心电图改变
窦性心跳减慢，ORS波群下降、T波下降、OT间距拉长。
3血液检查
血清蛋白、胰液淀粉酶与脂肪酶降低。如果有肝病，肝功能指数增高很多。如果无肝病，肝指数也常会增高。在断食期间，三酸甘油脂、胆固醇、尿酸都会升高，但断食完毕后都会下降。尿素氮(BUN)有人升高，有人降低。肌肝酸可能升高，也可能持平。断食期间，大部分人血糖下降，有人甚至会降到30ml／dl以下。断食完毕后，血糖会恢复健康值，原本血糖太高的人会下降，原本太低的会上升。全血检查通常显示红白血球的数目没有明显变化。若血红素增高、红血球数目增高，通常是因为喝水喝太少引起。红血球沉机率(ESR)通常会下降。
4尿液检查
尿中红血球、白血球、胆红素、尿蛋白、酮体、圆形柱状物(Cast)都会增加，如果有肝脏疾病，尿胆红素原(Urobilinogen)会增加。如果尿液比重增加，通常是因为喝水喝太少。
5荷尔蒙变化
胰岛素、甲状腺素下降。生长激素、肾上腺皮质醇(Cortisol)、升糖激素、血浆正肾上腺素、血清退黑激素、前列腺素增加。在肥胖的人身上，生长加速不增反减。
断食安全吗？
自从1880年开始，欧美发表的数百篇断食论文，数千名断食受试者，只有二人死亡，而且这二人死亡原因是本身的疾病造成，并不能完全怪断食。所以，断食的死亡率并不高。许多参与断食的患者，本5
身就患有重病，例如癌症、心血管疾病、肝病等等，本来就有可能在接下来的时间内自然死亡，死亡率就此常人高出很多，但参与断食不但死亡率降低，而且很多重症患者因此存活下来，这样看来，断食不但安全，而且可以逆转病情，提高存活率。